| 查看: 4903 | 回复: 5 | ||
[求助]
求助数据的处理，对照组为1时，对照组的标准偏差为啥不是0？ 已有1人参与
|
| RT-PCR处理数据，柱状图中，用倍数表示各处理组与对照组关系时，对照组数值为1，但为何还有标准偏差？想知道具体原理和处理过程，望各位大佬不吝赐教！十分感谢！ |
回复此楼» 猜你喜欢
宠物寄生虫防治：氟雷拉纳阻断GABA受体，持效12周驱杀跳蚤蜱虫
已经有0人回复
-
为呼吸打开通道：依伐卡托的科学之旅
已经有1人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有133人回复
-
Dordaviprone（ONC201）：小分子药物在中线胶质瘤中的应用
已经有0人回复
-
依喜替康：新型喜树碱衍生物的研究进展
已经有1人回复
-
膀胱癌靶向治疗新选择：厄达替尼作用机制与耐药研究进展
已经有0人回复
-
从水母到实验室：腔肠素的发现历程与生物发光奥秘
已经有1人回复
-
线粒体氧化磷酸化的新靶点：S-Gboxin的发现与研究进展
已经有0人回复
-
PROTAC药物开发选择VHL配体：MDK-7526以87%出口向量占有率成首选
已经有0人回复
-
MCC950：NLRP3炎症小体特异性抑制剂的科研应用与前景
已经有0人回复
-
康替唑胺研发17年：如何解决多重耐药菌感染难题
已经有0人回复
2楼2018-05-16 20:31:53
用户晓晓
木虫 (正式写手)
- MolEPI: 1
- 应助: 45 (小学生)
- 金币: 1693.7
- 散金: 129
- 红花: 12
- 帖子: 607
- 在线: 104.9小时
- 虫号: 1474220
- 注册: 2011-11-03
- 性别: GG
- 专业: 细胞增殖、生长与分化
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
浮生若惊梦: 金币+30, ★★★★★最佳答案, 讲得很好！ 2018-05-16 23:53:15
感谢参与，应助指数 +1
浮生若惊梦: 金币+30, ★★★★★最佳答案, 讲得很好！ 2018-05-16 23:53:15
|
对照组的1其实是归一化而来的，不是一个真实的表达量，而且是由对照组中的N个个体重复共同决定的，同样是一个平均值，肯定也有标准差，那这个标准差反应的就是对照组的组内差异！ 具体的计算：fold change这种计算的核心思想就是计算-ddCT时要减去对照组的平均值，这样导致对照组都是每个个体减去自己的平均值，那么对照组的-ddCT的平均值是0，那么2-0次方的值就是1。所以最终的结果对照组平均值就是1，其他组是根据对照组计算而来，其实就是与对照组的比值，所以这种思想叫做fold change。 祝楼主实验顺利！ |
3楼2018-05-16 23:05:59
4楼2018-05-16 23:53:48
用户晓晓
木虫 (正式写手)
- MolEPI: 1
- 应助: 45 (小学生)
- 金币: 1693.7
- 散金: 129
- 红花: 12
- 帖子: 607
- 在线: 104.9小时
- 虫号: 1474220
- 注册: 2011-11-03
- 性别: GG
- 专业: 细胞增殖、生长与分化
★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2018-05-17 07:52:25
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2018-05-17 07:52:25
|
其实我说的归一化也不准确，这种计算方法是相对定量，都是相对于内参基因的表达量，只是计算时都共同减了同一个数值（对照组平均值，或者所有组的平均值，或者最大值最小值都是OK的），所以具有了可比性。 发自小木虫Android客户端 |
5楼2018-05-17 00:05:32
6楼2018-05-17 10:05:48