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xmchh123456

新虫 (小有名气)

[求助] qPCR引物筛选

新手求教,请问荧光定量pcr如何进行引物筛选实验?体系是多少,是用设计的引物进行正常pcr后看电泳结果是否有杂带吗,只跑出一条目的条带是不是就说明这条引物可以用于荧光定量实验?加96孔板前要进行预实验荧光检测吗,怎么进行检测呢?谢谢!

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star013

新虫 (知名作家)


2楼2018-05-12 19:47:11
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wxm0212

新虫 (正式写手)

我觉得吧,还是看一些想关文献吧

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3楼2018-05-12 20:50:13
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xmchh123456

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by wxm0212 at 2018-05-12 20:50:13
我觉得吧,还是看一些想关文献吧

文献没有具体说明怎么做,也有可能是没查到,所以想通过论坛请教已做过的高手指点

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4楼2018-05-12 21:09:53
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luckydog52

木虫 (著名写手)

不是 很长时间不做有点记不清了。记着是看qPCR结果里的一个图。
引物二聚体和非特异扩增的图形不一样。

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自信源于一次次成功的积累
5楼2018-05-12 21:51:23
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xmchh123456

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by luckydog52 at 2018-05-12 21:51:23
不是 很长时间不做有点记不清了。记着是看qPCR结果里的一个图。
引物二聚体和非特异扩增的图形不一样。

引物筛选就是直接拿引物进行qPCR跑荧光定量检测是否有双峰吗?如果有双峰说明引物设计不好不能用是吗?还是怎么筛选引物?

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6楼2018-05-12 22:09:34
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wukangming

银虫 (小有名气)

体系试剂什么都是一样的。引物也不用筛选,直接在oligo或者PP5上设计出来给外面公司合成就行(赛默飞就很纯,完全不用担心有杂质)。引物一般是粉末状给你的,建议你先把这个引物稀释到适合浓度,然后去跑电泳,如果是一条带就基本说明引物没问题。做不出来一般都是你实验操作和环境问题,引物的筛选如果你找个好公司的话完全可以偷下懒。可以设置一个阴性对照、阳性对照,可以分别看看是不是环境污染或是实验步骤出错。
扩增效率没问题情况是90%-110%
R值最好>0.99

http://www.doc88.com/p-9955632672617.html

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

静水流深
7楼2018-05-13 00:00:27
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xmchh123456

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by wukangming at 2018-05-13 00:00:27
体系试剂什么都是一样的。引物也不用筛选,直接在oligo或者PP5上设计出来给外面公司合成就行(赛默飞就很纯,完全不用担心有杂质)。引物一般是粉末状给你的,建议你先把这个引物稀释到适合浓度,然后去跑电泳 ...

就是设计好引物然后直接扩增跑电泳,如果检测只有一条目的条带就可以直接拿来这对引物来做荧光定量了是吧?荧光定量结果只要R方大于0.99,没有双峰就说明这次荧光定量实验结果能用是吗

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8楼2018-05-13 10:19:52
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