| 查看: 1356 | 回复: 5 | |||
[交流]
Nature丨小生物,大基因:六角龙基因组测序揭开再生之谜
|
|||
|
“头上有犄角，身后有尾巴，”但它不是小龙人，而是六角恐龙”-美西钝口螈。如果你光看外表只觉得它萌萌哒很可亲，那么你可知他拥有强大的再生能力？近日就有这么一些研究者发表了美西钝口螈的研究结果。 Pacbio SMRT测序解密美西钝口螈再生之谜 1月24日，Nature在线发表美西钝口螈（Ambystoma mexicanum）（~32Gb）基因组组装结果，是迄今组装完成最大的基因组。来自全球10余家科研机构的研究者以共同第一作者在自然杂志（Nature）在线发表了题为“The axolotl genome and the evolution of key tissue formation regulators”（DOI: 10.1038/nature25458）的论文发表了美西螈基因组的基因组测序研究结果。 32×PacBio SMRT测序+Bionano光学图谱+MARVEL新算法。MARVEL新算法集成两阶段reads校正程序，可以保持长reads的完整性。组装Congtig N50：216kb，Scaffold N50：3Mb，基因组大小：32.4Gb。基因组中重复序列占65.6%（18.6Gb），说明如果能在长区段重复序列有很好的覆盖和跨越，对基因组组装起至关重要的作用。 图注：Axolotl全基因组序列测定及组装 研究人员将那些在再生肢体细胞中表达较丰富的基因和 microRNA 序列标记为进一步研究的目标，美西钝口螈基因组中不包含其它已知脊椎动物基本的发育基因Pax3，其基因功能由旁系同源基因Pax7 代偿。 研究表明尽管墨西哥钝口螈的基因组扩张至人类的10倍，然而通过深度的转录组学测序分析表明其编码基因的数量与其它物种比较无明显差别。存在于基因内含子区域及非基因区域的大量重复序列是导致蝾螈基因组扩张的主要原因。此外，通过进一步对墨西哥钝口螈基因组序列的分析，文章成功系统鉴定了普遍存在于其它物种中的重要基因家族（例如：hedgehogs以及Wnts）。 参考文献 Sergej Nowoshilow, Siegfried Schloissnig, Ji-Feng Fei , et al. The axolotl genome and the evolution of key tissue formation regulators.Nature.2018 信息来自网络，侵删 |
回复此楼» 猜你喜欢
江苏省优青门槛
已经有20人回复
-
心好累。今年我们部门提交了18个项目。中了11了，可惜我的又挂了
已经有10人回复
-
植物学论文润色/翻译怎么收费?
已经有51人回复
-
面上项目计划书
已经有7人回复
-
面上项目计划书附件
已经有9人回复
-
面上项目计划书系统状态
已经有18人回复
-
NSFC-UNEP（与联合国环境规划署）合作项目
已经有33人回复
-
和伊朗人合作
已经有32人回复
-
江苏省自然基金
已经有8人回复
-
生命科学新英文普刊《INVESTIGATION OF LIFE SCIENCE》
已经有10人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
沈阳化工大学环境学院生物技术与工程（无数学）、环境科学与工程可接受调剂
+1/584
-
蛋白质稳定性之小分子保护剂选择
+1/192
-
淮北师范大学资源与环境硕士研究生调剂名额充足（26人），欢迎调剂。
+2/130
-
物理学 调剂
+1/91
-
【调剂信息】山东科技大学（青岛校区）材料助剂研究团队招收调剂硕士研究生
+1/89
-
江西理工大学碳材料与新能源课题组招收2026年调剂生（学硕硕博连读）
+1/87
-
攀枝花学院大量招收调剂：材料科学与工程(学硕：0805)和材料工程（专硕：0856）
+1/53
-
北方民族大学085602化学工程有调剂名额58个，欢迎调剂！4月11日报到，12日现场复试
+1/43
-
台州学院医药化工学院2026年化学/化学工程硕士调剂研究生
+1/21
-
河南农业大学理学院招收化学（学硕）和材料与化工（专硕）专业硕士调剂生2名
+1/18
-
橡胶草种子求助
+1/10
-
长沙理工大学土木水利招收专硕调剂生
+1/10
-
26年申博自荐-计算机视觉
+1/7
-
烟台大学精准材料高等研究院26年材料方向研究生招生
+1/5
-
福建师范大学环境微生物技术课题组接受2026级硕士调剂
+1/5
-
中南大学材料学院李明教授课题组招收2026年全日制学术型博士生
+1/5
-
长江师范学院 材料工程 招收调剂学生 还有大量名额
+1/5
-
河北大学分析化学招收多名调剂考生
+1/3
-
广西民族大学材环学院资源与环境专硕、纳米科学与工程学硕调剂招生
+1/3
-
长江师范学院化学化工学院化学工程方向有大量调剂名额
+1/3
5楼2018-02-07 11:57:26
简单回复
gjbxch2楼
2018-02-07 11:32
回复
tzynew3楼
2018-02-07 11:33
回复
生物小虫007(金币+1): 谢谢参与
2018-02-07 11:35
回复
生物小虫007(金币+1): 谢谢参与
好
dbyws6楼
2018-02-07 12:18
回复
生物小虫007(金币+1): 谢谢参与
