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求助:下载的PDB文件是单体,怎样可以得到三聚体结构?
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如RCSB上,PDB ID : 1TNR,是TNFβ和受体蛋白的复合物。下载的PDB结构是1个配体和1个受体的复合物。https://www.rcsb.org/3d-view/1TNR/1 在3Dview界面可以选择assembly模式unit cell,结构显示为每3个复合物聚集在一起,形成3聚体。 我想知道下载的单一复合物pdb文件要怎么操作,得到这种3聚体复合物结构呢?谢谢 |
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hclwonder
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http://www.ebi.ac.uk/msd-srv/prot_int/pistart.html 这个网站可以,很简单,得到的结构需要能量优化一下。 发自小木虫Android客户端 |
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2楼2018-02-02 13:58:27
hclwonder
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chuxiao9299