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18795877368

新虫 (初入文坛)

[求助] 基因敲除

各位虫友大家好:
  我最近开始酿酒酵母基因的敲除工作,采用的是G418抗性同源重组替换,现在遇到问题:已经筛选得到了转化子,并且能够在含G418液体培养液里生长,但在验证是出现问题,验证引物2对,(被敲基因上游一段A,含G418抗性基因中间一段Kb,  )(抗性基因中间Kc  ,以及被敲基因下游一段D),现在问题是A-kb能够p出基因 但条带较淡且含有杂带  ,Kc-D就不出来,还望有酿酒酵母敲除经验的虫友们多多指教!谢谢.
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汤锐5211314

新虫 (初入文坛)

你好,本人最近也在做基因敲除。我做的是丝状真菌,之前也遇到过你的这种情况,我的处理办法是转化子纯化(单孢分离),然后重新提取基因组DNA,再次验证,搞定。我用的是split-marker重组。希望对你的实验有帮助。
    现在我也遇到了一个问题,实验材料换成了其他的一个丝状真菌,同样用的是split-marker重组技术进行基因敲除,后期获得好多转化子,均能在潮霉素抗性的平板上生长,提取基因组验证后发现目标基因和潮霉素基因均存在,就是所谓的假阳性。后期也调整和优化了实验参数与方案,单并未解决这个问题。一次转化能得到100多个转化子,但是目的基因均未别敲除。
    请问,你也遇到过类似的问题吗?请指教。谢谢
2楼2018-01-30 11:07:32
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Dandyliujun

新虫 (小有名气)

二楼,请问你的单包分离是怎么做的?

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3楼2018-01-30 23:59:41
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18795877368

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 汤锐5211314 at 2018-01-30 11:07:32
你好,本人最近也在做基因敲除。我做的是丝状真菌,之前也遇到过你的这种情况,我的处理办法是转化子纯化(单孢分离),然后重新提取基因组DNA,再次验证,搞定。我用的是split-marker重组。希望对你的实验有帮助。 ...

你好,我这个是已经划线挑单菌落提取了基因组来pcr的,一开始有条带,,不过大小不多,然后就以pcr产物为模板,再次pcr的,出现的2  3条条带,,其中包括了符合大小的条带,,请问这是什么原因呢,按道理如果没进去,都不应该有条带呢,,然后,你那个问题,我觉得一次转化子不会有那么多,会不会当中某个环节染了,我们之前也出现过的,都是把霉素倒掉重新配的,

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4楼2018-02-01 11:14:25
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6698

新虫 (正式写手)

5楼2021-03-22 21:45:21
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cTiyAmo

新虫 (初入文坛)

您好,酵母体内进行基因敲出怎么筛的呀

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6楼2022-03-02 09:58:59
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我心态崩了

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 汤锐5211314 at 2018-01-30 11:07:32
你好,本人最近也在做基因敲除。我做的是丝状真菌,之前也遇到过你的这种情况,我的处理办法是转化子纯化(单孢分离),然后重新提取基因组DNA,再次验证,搞定。我用的是split-marker重组。希望对你的实验有帮助。 ...

您好,请问您的问题解决了吗,我现在也遇到了这个情况,后期获得好多转化子,均能在潮霉素抗性的平板上生长,提取基因组验证后发现目标基因和潮霉素基因均存在,pcr验证时,除目的基因带外会出现杂带,目的基因带不清晰,请您指教,谢谢!
7楼2022-03-03 11:51:38
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cTiyAmo

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 我心态崩了 at 2022-03-03 11:51:38
您好,请问您的问题解决了吗,我现在也遇到了这个情况,后期获得好多转化子,均能在潮霉素抗性的平板上生长,提取基因组验证后发现目标基因和潮霉素基因均存在,pcr验证时,除目的基因带外会出现杂带,目的基因带不 ...

您好,我也出现了类似的问题,可以交流一下吗

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8楼2022-03-09 14:56:19
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