24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 3508  |  回复: 7

18795877368

新虫 (初入文坛)

[求助] 基因敲除

各位虫友大家好:
  我最近开始酿酒酵母基因的敲除工作,采用的是G418抗性同源重组替换,现在遇到问题:已经筛选得到了转化子,并且能够在含G418液体培养液里生长,但在验证是出现问题,验证引物2对,(被敲基因上游一段A,含G418抗性基因中间一段Kb,  )(抗性基因中间Kc  ,以及被敲基因下游一段D),现在问题是A-kb能够p出基因 但条带较淡且含有杂带  ,Kc-D就不出来,还望有酿酒酵母敲除经验的虫友们多多指教!谢谢.
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

汤锐5211314

新虫 (初入文坛)

你好,本人最近也在做基因敲除。我做的是丝状真菌,之前也遇到过你的这种情况,我的处理办法是转化子纯化(单孢分离),然后重新提取基因组DNA,再次验证,搞定。我用的是split-marker重组。希望对你的实验有帮助。
    现在我也遇到了一个问题,实验材料换成了其他的一个丝状真菌,同样用的是split-marker重组技术进行基因敲除,后期获得好多转化子,均能在潮霉素抗性的平板上生长,提取基因组验证后发现目标基因和潮霉素基因均存在,就是所谓的假阳性。后期也调整和优化了实验参数与方案,单并未解决这个问题。一次转化能得到100多个转化子,但是目的基因均未别敲除。
    请问,你也遇到过类似的问题吗?请指教。谢谢
2楼2018-01-30 11:07:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Dandyliujun

新虫 (小有名气)

二楼,请问你的单包分离是怎么做的?

发自小木虫Android客户端
3楼2018-01-30 23:59:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

18795877368

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 汤锐5211314 at 2018-01-30 11:07:32
你好,本人最近也在做基因敲除。我做的是丝状真菌,之前也遇到过你的这种情况,我的处理办法是转化子纯化(单孢分离),然后重新提取基因组DNA,再次验证,搞定。我用的是split-marker重组。希望对你的实验有帮助。 ...

你好,我这个是已经划线挑单菌落提取了基因组来pcr的,一开始有条带,,不过大小不多,然后就以pcr产物为模板,再次pcr的,出现的2  3条条带,,其中包括了符合大小的条带,,请问这是什么原因呢,按道理如果没进去,都不应该有条带呢,,然后,你那个问题,我觉得一次转化子不会有那么多,会不会当中某个环节染了,我们之前也出现过的,都是把霉素倒掉重新配的,

发自小木虫Android客户端
4楼2018-02-01 11:14:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

6698

新虫 (正式写手)

5楼2021-03-22 21:45:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cTiyAmo

新虫 (初入文坛)

您好,酵母体内进行基因敲出怎么筛的呀

发自小木虫Android客户端
6楼2022-03-02 09:58:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

我心态崩了

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 汤锐5211314 at 2018-01-30 11:07:32
你好,本人最近也在做基因敲除。我做的是丝状真菌,之前也遇到过你的这种情况,我的处理办法是转化子纯化(单孢分离),然后重新提取基因组DNA,再次验证,搞定。我用的是split-marker重组。希望对你的实验有帮助。 ...

您好,请问您的问题解决了吗,我现在也遇到了这个情况,后期获得好多转化子,均能在潮霉素抗性的平板上生长,提取基因组验证后发现目标基因和潮霉素基因均存在,pcr验证时,除目的基因带外会出现杂带,目的基因带不清晰,请您指教,谢谢!
7楼2022-03-03 11:51:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cTiyAmo

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 我心态崩了 at 2022-03-03 11:51:38
您好,请问您的问题解决了吗,我现在也遇到了这个情况,后期获得好多转化子,均能在潮霉素抗性的平板上生长,提取基因组验证后发现目标基因和潮霉素基因均存在,pcr验证时,除目的基因带外会出现杂带,目的基因带不 ...

您好,我也出现了类似的问题,可以交流一下吗

发自小木虫Android客户端
8楼2022-03-09 14:56:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 18795877368 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[文学芳草园] 献血感触 +6 呀呀好傻 2026-05-19 11/550 2026-05-19 22:26 by 而立得乐
[教师之家] 上海大学实验技术岗位非升即走 +11 嘻嘻哈哈乐呵呵 2026-05-15 12/600 2026-05-19 22:17 by otani
[基金申请] 评审有感 +11 popular289 2026-05-18 17/850 2026-05-19 22:09 by 一碗砂锅米线
[考博] 云南大学材料与能源学院解琳课题组钙钛矿博士招生 +3 光伏爱好者 2026-05-17 5/250 2026-05-19 19:13 by 光伏爱好者
[基金申请] 2026山东省优青 +3 luckinging 2026-05-14 4/200 2026-05-19 16:15 by 52wls
[有机交流] 反应很差,大量原料没有反应 5+3 Mr.Zot 2026-05-19 3/150 2026-05-19 13:56 by xtlilibin
[考博] 找博士生导师 +6 小代想上岸 2026-05-15 7/350 2026-05-19 10:22 by free_fisher
[基金申请] 同样的基金本子,换个专家直接从C变A! +3 国自然国社科中 2026-05-19 3/150 2026-05-19 08:50 by Equinoxhua
[考博] 2026博士还有哪些学校有名额 +7 小王求读研 2026-05-15 8/400 2026-05-19 08:27 by zhyzzh
[考博] 博士申请 +5 星…… 2026-05-18 6/300 2026-05-18 23:49 by 糊糊涂涂好
[基金申请] 国自然上会要求 +5 无名者登山 2026-05-18 9/450 2026-05-18 17:50 by BlakeReary
[基金申请] 青C资助名额大幅增加! +12 西葫芦炒鸡蛋 2026-05-13 16/800 2026-05-18 10:02 by Equinoxhua
[基金申请] 重磅!青年科学基金项目(C类)资助增幅预计超过50% +7 水和泥不是水泥 2026-05-13 10/500 2026-05-18 07:50 by 水和泥不是水泥
[硕博家园] 我在等一个没有答案的答案 +3 Love_MH 2026-05-17 3/150 2026-05-18 02:22 by 竹林孤影
[文学芳草园] 半夜喝咖啡 +3 myrtle 2026-05-15 5/250 2026-05-18 01:03 by 小沈2018
[有机交流] 求助2,4-二氯-5-嘧啶甲醛的合成方法 20+3 光吃不拉 2026-05-14 6/300 2026-05-16 19:46 by Equinoxhua
[有机交流] 求有机合成大神指点三硫酸乙烯酯(CAS:2793408-99-6)的合成路线 30+3 Leekmid 2026-05-13 10/500 2026-05-16 16:37 by czyzsu
[硕博家园] 申请博士 +3 呃?呃 2026-05-15 3/150 2026-05-16 11:01 by a4742549
[教师之家] 教学课件你会给同学吗 +8 硕士研究生吗 2026-05-13 8/400 2026-05-14 22:23 by 常规沥青
[考博] 材料类只有一篇综述能申博么 +4 乐逍遥谷 2026-05-13 4/200 2026-05-14 12:05 by zhyzzh
信息提示
请填处理意见