24小时热门版块排行榜    

查看: 2984  |  回复: 8

吉米爱多

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 模拟时时间步长的选择,1fs和2fs对结果有影响吗 已有3人参与

看到文献中多数用了1fs,但也有一些用了2fs。单纯从计算速度看,2fs有优势。请问各位1fs和2fs区别在哪里?能发一下相关链接讲这个问题是最好啦。还有就是,在一项研究中,可否采用不同的时间步长?
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

awaken2013

铜虫 (小有名气)

体系容易崩溃 最好1fs

发自小木虫IOS客户端

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2018-01-14 16:32:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chuntao118

新虫 (著名写手)

MD模拟选择时间步长通常的选择是考虑计算效率的同时,兼顾体系能够达到平衡态。一般会选择分子健震动周期的十分之一。这个可以参考陈正隆著的分子动力学教材!

发自小木虫Android客户端

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2018-01-14 20:40:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

brucefan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
莫问这个,看书书书书书书去。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2018-01-15 06:46:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

吉米爱多

铁杆木虫 (著名写手)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by chuntao118 at 2018-01-14 20:40:30
MD模拟选择时间步长通常的选择是考虑计算效率的同时,兼顾体系能够达到平衡态。一般会选择分子健震动周期的十分之一。这个可以参考陈正隆著的分子动力学教材!

谢谢
5楼2018-01-15 11:17:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

吉米爱多

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by awaken2013 at 2018-01-14 16:32:16
体系容易崩溃 最好1fs

谢谢
6楼2018-01-15 11:17:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
吉米爱多: 金币+10, ★★★很有帮助 2018-02-10 10:36:41
一般会选择分子键震动周期的十分之一,而H键震动周期的十分之一恰好是1fs,所以,体系中含H时,最好选择我1fs
7楼2018-01-15 16:17:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gezhenpeng

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
吉米爱多: 金币+10, ★★★很有帮助 2018-02-10 10:36:54
分子动力学中一般把键设成rigid。大多数体系崩溃问题都不是步长导致的
8楼2018-02-01 11:18:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

吉米爱多

铁杆木虫 (著名写手)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by awaken2013 at 2018-01-14 16:32:16
体系容易崩溃 最好1fs

9楼2018-02-10 10:39:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 吉米爱多 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0817 化学工程 299分求调剂 有科研经历 有二区文章 +21 rare12345 2026-03-18 21/1050 2026-03-20 14:31 by 无懈可击111
[考研] 274求调剂 +8 S.H1 2026-03-18 8/400 2026-03-20 11:53 by 学员8dgXkO
[考研] 能源材料化学课题组招收硕士研究生8-10名 +5 脱颖而出 2026-03-16 14/700 2026-03-20 09:30 by kkcoco25
[考研] 271材料工程求调剂 +7 .6lL 2026-03-18 7/350 2026-03-20 09:10 by xingguangj
[考研] 307求调剂 +9 冷笙123 2026-03-17 9/450 2026-03-19 22:44 by 学员8dgXkO
[考研] 288求调剂,一志愿华南理工大学071005 +5 ioodiiij 2026-03-17 5/250 2026-03-19 18:22 by zcl123
[考研] 0703化学调剂 +5 pupcoco 2026-03-17 8/400 2026-03-19 13:58 by houyaoxu
[考研] 一志愿985,本科211,0817化学工程与技术319求调剂 +10 Liwangman 2026-03-15 10/500 2026-03-19 10:25 by 无际的草原
[考研] 08工科 320总分 求调剂 +5 梨花珞晚风 2026-03-17 5/250 2026-03-18 14:49 by haxia
[考研] 一志愿西南交大,求调剂 +4 材化逐梦人 2026-03-18 4/200 2026-03-18 14:22 by 007_lilei
[考研] 280求调剂 +6 咕噜晓晓 2026-03-18 7/350 2026-03-18 11:25 by 无际的草原
[考研] 268求调剂 +6 简单点0 2026-03-17 6/300 2026-03-18 09:04 by 无际的草原
[考博] 26博士申请 +3 1042136743 2026-03-17 3/150 2026-03-17 23:30 by 轻松不少随
[考研] 308求调剂 +4 是Lupa啊 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:12 by ruiyingmiao
[考研] 一志愿,福州大学材料专硕339分求调剂 +3 木子momo青争 2026-03-15 3/150 2026-03-17 07:52 by laoshidan
[考研] [导师推荐]西南科技大学国防/材料导师推荐 +3 尖角小荷 2026-03-16 6/300 2026-03-16 23:21 by 尖角小荷
[考研] 318求调剂 +3 Yanyali 2026-03-15 3/150 2026-03-16 16:41 by houyaoxu
[考研] 0856求调剂 +3 刘梦微 2026-03-15 3/150 2026-03-16 10:00 by houyaoxu
[考研] 326求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-15 3/150 2026-03-16 07:33 by Iveryant
[考研] 070305求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-14 4/200 2026-03-15 11:04 by peike
信息提示
请填处理意见