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吉米爱多

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 模拟时时间步长的选择,1fs和2fs对结果有影响吗 已有3人参与

看到文献中多数用了1fs,但也有一些用了2fs。单纯从计算速度看,2fs有优势。请问各位1fs和2fs区别在哪里?能发一下相关链接讲这个问题是最好啦。还有就是,在一项研究中,可否采用不同的时间步长?
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awaken2013

铜虫 (小有名气)

体系容易崩溃 最好1fs

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» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2018-01-14 16:32:16
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chuntao118

新虫 (著名写手)

MD模拟选择时间步长通常的选择是考虑计算效率的同时,兼顾体系能够达到平衡态。一般会选择分子健震动周期的十分之一。这个可以参考陈正隆著的分子动力学教材!

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» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2018-01-14 20:40:30
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brucefan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
莫问这个,看书书书书书书去。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2018-01-15 06:46:55
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吉米爱多

铁杆木虫 (著名写手)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by chuntao118 at 2018-01-14 20:40:30
MD模拟选择时间步长通常的选择是考虑计算效率的同时,兼顾体系能够达到平衡态。一般会选择分子健震动周期的十分之一。这个可以参考陈正隆著的分子动力学教材!

谢谢
5楼2018-01-15 11:17:12
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吉米爱多

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by awaken2013 at 2018-01-14 16:32:16
体系容易崩溃 最好1fs

谢谢
6楼2018-01-15 11:17:28
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
吉米爱多: 金币+10, ★★★很有帮助 2018-02-10 10:36:41
一般会选择分子键震动周期的十分之一,而H键震动周期的十分之一恰好是1fs,所以,体系中含H时,最好选择我1fs
7楼2018-01-15 16:17:40
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gezhenpeng

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
吉米爱多: 金币+10, ★★★很有帮助 2018-02-10 10:36:54
分子动力学中一般把键设成rigid。大多数体系崩溃问题都不是步长导致的
8楼2018-02-01 11:18:16
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吉米爱多

铁杆木虫 (著名写手)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by awaken2013 at 2018-01-14 16:32:16
体系容易崩溃 最好1fs

9楼2018-02-10 10:39:09
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