| 查看: 1109 | 回复: 1 | ||||
1239249493新虫 (初入文坛)
|
[求助]
求助amber算径向分布函数(RDF)详细步骤! 已有1人参与
|
| 请问各位谁会用amber中的cpptraj算径向分布函数(RDF)?求详细步骤,谢谢! |
» 猜你喜欢
有没有人能给点建议
已经有5人回复
假如你的研究生提出不合理要求
已经有12人回复
实验室接单子
已经有7人回复
全日制(定向)博士
已经有5人回复
萌生出自己或许不适合搞科研的想法,现在跑or等等看?
已经有4人回复
Materials Today Chemistry审稿周期
已经有4人回复
参与限项
已经有3人回复
对氯苯硼酸纯化
已经有3人回复
所感
已经有4人回复
要不要辞职读博?
已经有7人回复
brucefan
专家顾问 (著名写手)
-

专家经验: +218 - 模拟EPI: 4
- 应助: 422 (硕士)
- 金币: 2294.8
- 散金: 1720
- 红花: 88
- 帖子: 1423
- 在线: 670.2小时
- 虫号: 3048965
- 注册: 2014-03-14
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II :电子结构
- 管辖: 分子模拟
【答案】应助回帖
感谢参与,应助指数 +1
|
It is very easy to write a code to compute RDF after you have a trajectory. Why always rely on such black boxes? Check the matlab code I provided: http://blog.sciencenet.cn/blog-3102863-1084245.html Also note that you may need to extend or modify it before you can use it. Therefore, it is important that you understand the theory and algorithm. So here is the 详细步骤: 1) read a good MD or statistical physics book on RDF; 2) write a few tens of lines code to solve this problem. |
2楼2017-12-06 06:02:50












回复此楼