| 查看: 1173 | 回复: 1 | ||||
1239249493新虫 (初入文坛)
|
[求助]
求助amber算径向分布函数（RDF）详细步骤！ 已有1人参与
|
| 请问各位谁会用amber中的cpptraj算径向分布函数（RDF）？求详细步骤，谢谢！ |
回复此楼» 猜你喜欢
E口会评
已经有6人回复
-
不要再数国自然申请书的 filecode 的分隔符个数了
已经有18人回复
-
轴手性化合物的确定
已经有5人回复
-
MSER送审了还被拒稿
已经有6人回复
-
内心匮乏
已经有7人回复
-
明天E口面上会评
已经有8人回复
-
祈祷青基必中
已经有16人回复
-
生命口会评
已经有12人回复
-
27届辽宁大学应届毕业生申博
已经有3人回复
-
关于如何从代码看上不上会
已经有23人回复
brucefan
专家顾问 (著名写手)
-
专家经验: +218 - 模拟EPI: 4
- 应助: 422 (硕士)
- 金币: 2294.8
- 散金: 1720
- 红花: 88
- 帖子: 1423
- 在线: 670.2小时
- 虫号: 3048965
- 注册: 2014-03-14
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
- 管辖: 分子模拟
【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
|
It is very easy to write a code to compute RDF after you have a trajectory. Why always rely on such black boxes? Check the matlab code I provided: http://blog.sciencenet.cn/blog-3102863-1084245.html Also note that you may need to extend or modify it before you can use it. Therefore, it is important that you understand the theory and algorithm. So here is the 详细步骤: 1) read a good MD or statistical physics book on RDF; 2) write a few tens of lines code to solve this problem. |
2楼2017-12-06 06:02:50