| 查看: 1143 | 回复: 1 | ||||
1239249493新虫 (初入文坛)
|
[求助]
求助amber算径向分布函数（RDF）详细步骤！ 已有1人参与
|
| 请问各位谁会用amber中的cpptraj算径向分布函数（RDF）？求详细步骤，谢谢！ |
回复此楼» 猜你喜欢
2026年申博-电池方向
已经有8人回复
-
导师各种操作恶心咋办
已经有8人回复
-
2026博士申请求助
已经有5人回复
-
研究生做的很差，你们会让毕业吗？
已经有11人回复
-
求碳排放博导；方向是LCA、生命周期可持续发展以及碳排放
已经有7人回复
-
2026博士或科研助理转27年博士
已经有7人回复
-
急招2026年9月份入学博士
已经有3人回复
-
国自科送审了吗
已经有11人回复
-
博士招生
已经有5人回复
brucefan
专家顾问 (著名写手)
-
专家经验: +218 - 模拟EPI: 4
- 应助: 422 (硕士)
- 金币: 2294.8
- 散金: 1720
- 红花: 88
- 帖子: 1423
- 在线: 670.2小时
- 虫号: 3048965
- 注册: 2014-03-14
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
- 管辖: 分子模拟
【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
|
It is very easy to write a code to compute RDF after you have a trajectory. Why always rely on such black boxes? Check the matlab code I provided: http://blog.sciencenet.cn/blog-3102863-1084245.html Also note that you may need to extend or modify it before you can use it. Therefore, it is important that you understand the theory and algorithm. So here is the 详细步骤: 1) read a good MD or statistical physics book on RDF; 2) write a few tens of lines code to solve this problem. |
2楼2017-12-06 06:02:50