版块导航: 正在加载中...

登录注册

应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜

返回列表

1239249493

新虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 452
红花: 1
帖子: 3
在线: 10.1小时
虫号: 3907502
注册: 2015-06-04
专业: 高分子组装与超分子结构

[求助] 求助amber算径向分布函数（RDF）详细步骤！已有1人参与

请问各位谁会用amber中的cpptraj算径向分布函数（RDF）？求详细步骤，谢谢！

回复此楼

» 猜你喜欢

26年申博自荐-计算机视觉已经有4人回复
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急已经有3人回复
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急已经有4人回复
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急已经有4人回复
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急已经有3人回复
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急已经有3人回复
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急已经有3人回复
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急已经有4人回复
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急已经有3人回复
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急已经有4人回复

1楼 2017-12-05 16:09:58

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

brucefan

专家顾问 (著名写手)

专家经验: +218
模拟EPI: 4
应助: 422 (硕士)
金币: 2294.8
散金: 1720
红花: 88
帖子: 1423
在线: 670.2小时
虫号: 3048965
注册: 2014-03-14
性别: GG
专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
管辖: 分子模拟

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1

It is very easy to write a code to compute RDF after you have a trajectory.
Why always rely on such black boxes?
Check the matlab code I provided:
http://blog.sciencenet.cn/blog-3102863-1084245.html
Also note that you may need to extend or modify it before you can use it.
Therefore, it is important that you understand the theory and algorithm.

So here is the 详细步骤:
1) read a good MD or statistical physics book on RDF;
2) write a few tens of lines code to solve this problem.

赞一下