| 查看: 1981 | 回复: 5 | ||
[求助]
sander.MPI并行运算速度慢
|
| 请问各位老师，使用AmberTools14软件跑动力学，蛋白有473个残基，加上水盒后有91654个原子，sander.MPI加速，32个核并行，感觉跑的特别慢，一天只能跑约1.5ns，请问这样的速度正常么？如果不正常，是我安装还是什么地方出了问题？ |
回复此楼» 猜你喜欢
评委有多少概率知道其他专家手中有哪些人的本子？
已经有4人回复
-
E0414, 我的本子有没有希望？
已经有17人回复
-
青A35岁以下通知答辩了吗
已经有4人回复
-
小城的小雨
已经有3人回复
-
看《给阿ma的情书》有感
已经有5人回复
-
国自然申请五篇代表作大比拼，感觉这个是最重要的
已经有4人回复
-
雷雨
已经有3人回复
hclwonder
新虫 (正式写手)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 2564.1
- 红花: 28
- 帖子: 371
- 在线: 68.2小时
- 虫号: 2837657
- 注册: 2013-11-30
- 性别: GG
- 专业: 药物设计与药物信息
2楼2017-11-19 12:15:25
hclwonder
新虫 (正式写手)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 2564.1
- 红花: 28
- 帖子: 371
- 在线: 68.2小时
- 虫号: 2837657
- 注册: 2013-11-30
- 性别: GG
- 专业: 药物设计与药物信息
3楼2017-11-19 12:18:05
4楼2017-11-19 12:18:36
lpxmclt
新虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 867.7
- 帖子: 85
- 在线: 91.8小时
- 虫号: 3040659
- 注册: 2014-03-11
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
5楼2017-11-19 15:38:51
6楼2017-11-20 09:53:26