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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 大家看一下我设计的引物有没有问题
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)
引用回帖:
Originally posted by chemifunan at 2009/2/23, 18:24:
楼主我不清楚你的用途是什么 一般PCR引物用于验证或者普通扩增 通常在15-20个碱基 有正反两条 分别位于所扩增序列的两端 楼主提供的引物序列是同一位置的但是设计了四个长度不知如何使用
正反两条通常保证配对碱 ...

我联想到他发了另外个贴，不是用于做PCR的
他的用意只是用于研究DNA二级结构而已~~
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11楼2009-02-23 18:27:18
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chemifunan

木虫 (正式写手)

海王小木虫
不好意思 楼主 我刚看到5楼的留言
我不知道你的模板 所以不知怎么加碱基
引物由生物公司合成 我们提供序列 他们送过来 一般是单链的 PCR仪器本身提供变性程序 所以PCR过程中模板变性 然后退火 引物就上去了 然后开聚

您是用DNA做催化剂吗 好像RNA才可以吧 要是就把T换成U
DNA形成正确的双螺旋结构必须在体内才可以 体外形成的结构都是不能严格模拟体内的 而且PCR的产物没有后修饰

如果你要单独合成这个的互补对 可以另外根据Waston规则写一个 但是合成完是两个 （就像质粒定点突变的引物一样） 但是它们也不是严格从头到尾一一配对的 不知您所说的配对是什么意思

另外JACS上搜一下 我看JACS上做核酸的还不少
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Bemühen Sie !
12楼2009-02-23 18:34:22
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chemifunan

木虫 (正式写手)

海王小木虫
DNA二级结构是纯生化的啊真奇怪
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Bemühen Sie !
13楼2009-02-23 18:36:40
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chemhcl

引用回帖:
Originally posted by chemifunan at 2009-2-23 18:34:
不好意思 楼主 我刚看到5楼的留言
我不知道你的模板 所以不知怎么加碱基
引物由生物公司合成 我们提供序列 他们送过来 一般是单链的 PCR仪器本身提供变性程序 所以PCR过程中模板变性 然后退火 引物就上去了 然后 ...

你好！
我是做荧光共振能量转移的，现在要利用FRET技术测定DNA分子的二级结构，现在需要设计一系列的DNA序列，不需要扩增，所以我只要设计出合理的DNA序列，让上海生工合成就行。
但现在是我不知道设计引物需要注意什么，只查到说G+C的含量需要在40%-60%，别的一概不知。周围的人也没有做这方面的，所以我只能上这里求助了。谢谢你的意见。
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14楼2009-02-23 20:39:21
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