24小时热门版块排行榜    

查看: 646  |  回复: 13
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

chemhcl

[交流] 大家看一下我设计的引物有没有问题

12个bp  5'-TTA AGT GCT CAA-3'
16个bp  5'-TTA AGT GCT CAA TGA A-3'
20个bp  5'-TTA AGT GCT CAA TGA ATT AA-3'
24个bp  5'-TTA AGT GCT CAA TGA ATT AAT CAA-3'
这是我设计的DNA引物序列,各位虫友要是有检测 评价引物序列软件的能不能给我看一下有什么问题?
先谢谢了!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chemifunan

木虫 (正式写手)

海王小木虫

不好意思 楼主 我刚看到5楼的留言
我不知道你的模板 所以不知怎么加碱基
引物由生物公司合成 我们提供序列 他们送过来 一般是单链的 PCR仪器本身提供变性程序 所以PCR过程中模板变性 然后退火 引物就上去了 然后开聚

您是用DNA做催化剂吗 好像RNA才可以吧 要是就把T换成U
DNA形成正确的双螺旋结构必须在体内才可以 体外形成的结构都是不能严格模拟体内的 而且PCR的产物没有后修饰

如果你要单独合成这个的互补对 可以另外根据Waston规则写一个 但是合成完是两个 (就像质粒定点突变的引物一样) 但是它们也不是严格从头到尾一一配对的 不知您所说的配对是什么意思

另外JACS上搜一下 我看JACS上做核酸的还不少
Bemühen Sie !
12楼2009-02-23 18:34:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答

三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)


chemhcl(金币+1,VIP+0):谢谢! 2-23 17:21
引物那么短?12、14个bp也太短了吧~~
所有引物都会形成比较厉害的发夹结构……肉眼一看就知道了~~
2楼2009-02-23 17:10:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jasco

木虫 (正式写手)

GC好少,都是AT啊
3楼2009-02-23 17:20:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

muchong5577

金虫 (正式写手)


chemhcl(金币+1,VIP+0):谢谢! 2-23 17:23
这样的引物,无语啦!
短、严重的发夹结构、一般不以A作为3末端
4楼2009-02-23 17:21:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见