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chemhcl

[交流] 大家看一下我设计的引物有没有问题

12个bp  5'-TTA AGT GCT CAA-3'
16个bp  5'-TTA AGT GCT CAA TGA A-3'
20个bp  5'-TTA AGT GCT CAA TGA ATT AA-3'
24个bp  5'-TTA AGT GCT CAA TGA ATT AAT CAA-3'
这是我设计的DNA引物序列,各位虫友要是有检测 评价引物序列软件的能不能给我看一下有什么问题?
先谢谢了!
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

引用回帖:
Originally posted by chemifunan at 2009/2/23, 18:24:
楼主我不清楚你的用途是什么 一般PCR引物用于验证或者普通扩增 通常在15-20个碱基 有正反两条 分别位于所扩增序列的两端 楼主提供的引物序列是同一位置的但是设计了四个长度不知如何使用
正反两条通常保证配对碱 ...

我联想到他发了另外个贴,不是用于做PCR的
他的用意只是用于研究DNA二级结构而已~~
11楼2009-02-23 18:27:18
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)


chemhcl(金币+1,VIP+0):谢谢! 2-23 17:21
引物那么短?12、14个bp也太短了吧~~
所有引物都会形成比较厉害的发夹结构……肉眼一看就知道了~~
2楼2009-02-23 17:10:24
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jasco

木虫 (正式写手)

GC好少,都是AT啊
3楼2009-02-23 17:20:42
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muchong5577

金虫 (正式写手)


chemhcl(金币+1,VIP+0):谢谢! 2-23 17:23
这样的引物,无语啦!
短、严重的发夹结构、一般不以A作为3末端
4楼2009-02-23 17:21:27
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