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chemhcl

[交流] 大家看一下我设计的引物有没有问题

12个bp  5'-TTA AGT GCT CAA-3'
16个bp  5'-TTA AGT GCT CAA TGA A-3'
20个bp  5'-TTA AGT GCT CAA TGA ATT AA-3'
24个bp  5'-TTA AGT GCT CAA TGA ATT AAT CAA-3'
这是我设计的DNA引物序列,各位虫友要是有检测 评价引物序列软件的能不能给我看一下有什么问题?
先谢谢了!
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chemhcl

引用回帖:
Originally posted by chemifunan at 2009-2-23 18:34:
不好意思 楼主 我刚看到5楼的留言
我不知道你的模板 所以不知怎么加碱基
引物由生物公司合成 我们提供序列 他们送过来 一般是单链的 PCR仪器本身提供变性程序 所以PCR过程中模板变性 然后退火 引物就上去了 然后 ...

你好!
我是做荧光共振能量转移的,现在要利用FRET技术测定DNA分子的二级结构,现在需要设计一系列的DNA序列,不需要扩增,所以我只要设计出合理的DNA序列,让上海生工合成就行。
但现在是我不知道设计引物需要注意什么,只查到说G+C的含量需要在40%-60%,别的一概不知。周围的人也没有做这方面的,所以我只能上这里求助了。谢谢你的意见。
14楼2009-02-23 20:39:21
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)


chemhcl(金币+1,VIP+0):谢谢! 2-23 17:21
引物那么短?12、14个bp也太短了吧~~
所有引物都会形成比较厉害的发夹结构……肉眼一看就知道了~~
2楼2009-02-23 17:10:24
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jasco

木虫 (正式写手)

GC好少,都是AT啊
3楼2009-02-23 17:20:42
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muchong5577

金虫 (正式写手)


chemhcl(金币+1,VIP+0):谢谢! 2-23 17:23
这样的引物,无语啦!
短、严重的发夹结构、一般不以A作为3末端
4楼2009-02-23 17:21:27
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