24小时热门版块排行榜    

查看: 986  |  回复: 12
当前主题已经存档。

muchong5577

金虫 (正式写手)

[交流] 引物快到了,PCR用什么酶比较好?

请问大家,从放线菌基因组扩增几条800bp到1200bp、GC含量为70-75%的片段,用什么酶比较好?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

★
lwf991229(金币+1,VIP+0):辛苦~ 2-23 21:46
这个GC比有点高
如果你不愿意用比较贵的酶,那么可以用Promega的GoTaq配合添加DMSO来做,这个是入门级的方法,当然比较折腾。或许可以试试看不加DMSO,然后把变性提高到95℃,1min试试
还有一些扩增能力比较强的酶,一般不用DMSO,如Invitrogen的白金Taq,这个会稍微贵一点
另外也有一些日系的产品会有很多针对性的酶,比如KOD FX,广告是卖得挺好的,不知道实际如何,这个不算太贵
不推荐使用Takara的酶,保证折腾死你……

如果不愁经费,那么用扩增能力强的酶,一次过做出来,不折腾
如果那个啥的话,经典的方法就是添加DMSO了,具体浓度需要自己摸
一般从2%加到15%左右,以1%为梯度摸
2楼2009-02-23 17:04:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

muchong5577

金虫 (正式写手)

嗯  谢谢啦
3楼2009-02-23 17:12:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chemifunan

木虫 (正式写手)

海王小木虫

★
lwf991229(金币+1,VIP+0):欢迎常来`~ 2-23 21:46
放线菌DNA通常GC在70左右 第三位GC可达90 我没有看你的引物 一般比大肠的短几个就可以了
酶没有要求 普通Taq就可以 你是湖师的 我知道你是哪个组的了 哈哈
如果需要高保真 用PRimer 不过这个酶程序和普通Taq不一样 退火10s钟就行
Bemühen Sie !
4楼2009-02-23 18:50:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chemifunan

木虫 (正式写手)

海王小木虫

哦 一定要添加8-10%的DMSO 保证高GC模板变性时单链稳定 甘油也可以 不过我没试过 我一般就用DMSO
Bemühen Sie !
5楼2009-02-23 18:52:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

muchong5577

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by muchong5577 at 2009-2-23 17:12:
嗯  谢谢啦

你怎么知道我?
普通Taq+DMSO我去年做过,加DMSO的 ,你能否给我一个反应体系。
6楼2009-02-23 19:23:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

muchong5577

金虫 (正式写手)

Quote里的内容错啦
7楼2009-02-23 19:24:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sutao1979

木虫 (著名写手)

小木虫10年groupleader

可以先用扩增长序列的taq酶看看结果怎么样?如果因为gc含量高的话而结果不理想,再用DMSO一般不要超过10%不然特异性还是会降低的
会当凌绝顶,一览众山小
8楼2009-02-23 20:09:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chemifunan

木虫 (正式写手)

海王小木虫

★
lwf991229(金币+1,VIP+0):辛苦~ 2-25 13:25
10* Taqbuffer(Mg++ contained) 2.5uL
DMSO 2uL
dNTP(买来的浓度 我忘了 不要加多了) 2uL
模板 0.5uL或者更少
引物 1uL
Taq 1uL 最后加
水 up to 25uL
我一般25uL P 发现和50 100一样 还省东西 很好

引物的处理: 你一般合成几个OD 1-2个足够 送来的先12000rpm离两分钟 然后加水溶比如35.5nmol 就加355uL水或TE 我一般用水 灭了分装冻-80没事的 然后溶了的Stock Solution冻-80 取一点稀释10倍 这样就是100mM稀释到10mM 这个浓度的在25或50ul体系中加入1uL
引物别加太多了 没用的 反而p不出来 你是Streptomyces? 这个链霉菌就是这样 其他的Actenomyces也差不多
测序可能会有些问题 你在测序单上注明 高GC 70左右 他们会处理的
Bemühen Sie !
9楼2009-02-25 12:06:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小猫三两只

金虫 (正式写手)

东洋坊的KOD 和Blend Taq都不错的
10楼2009-02-25 12:25:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 muchong5577 的主题更新
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 8/400 2026-11-05 13:44 by My20PsvIExYO
[考研] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 9/450 2026-11-05 13:33 by My20PsvIExYO
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 kvewwGtKktqB 2026-11-04 6/300 2026-11-05 13:22 by My20PsvIExYO
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 kvewwGtKktqB 2026-11-04 11/550 2026-11-05 13:13 by My20PsvIExYO
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 9/450 2026-11-05 13:11 by My20PsvIExYO
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 9/450 2026-11-05 13:11 by My20PsvIExYO
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-05 13:11 by My20PsvIExYO
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 7/350 2026-11-05 13:00 by My20PsvIExYO
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 8/400 2026-11-05 13:00 by My20PsvIExYO
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 17/850 2026-11-05 12:51 by My20PsvIExYO
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 6/300 2026-11-05 12:16 by My20PsvIExYO
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 7/350 2026-11-05 11:12 by PYZmcHr5kSaq
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-05 11:10 by PYZmcHr5kSaq
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 8/400 2026-11-05 11:01 by PYZmcHr5kSaq
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 8/400 2026-11-05 10:59 by PYZmcHr5kSaq
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +5 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 14/700 2026-11-05 10:48 by PYZmcHr5kSaq
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-05 10:48 by PYZmcHr5kSaq
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 10/500 2026-11-05 10:39 by PYZmcHr5kSaq
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 hNpp4Y2CGvSC 2026-11-04 9/450 2026-11-05 09:20 by PYZmcHr5kSaq
[基金申请] 各位基础老师们,看完中央《从严治党》的决定后,对学术界更加有信心了吧 +5 iaeyuan 2026-11-01 5/250 2026-11-04 14:43 by jinchengzi
信息提示
请填处理意见