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luweidong401

金虫 (著名写手)

[求助] 同源模建后,蛋白与配体的对接问题

各位专家,PDB数据库中一个蛋白结晶与我要分析的蛋白的氨基酸同源性达45%,但是这两个蛋白的底物不同,请问如何分析我的目的蛋白与自身底物的对接情况?
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hellololo

金虫 (小有名气)

请问楼主用什么建模的,正在学习,谢谢
4楼2017-10-20 14:32:27
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hclwonder

新虫 (正式写手)

先同源模建,然后把配体对接进去啊

发自小木虫Android客户端
2楼2017-10-19 18:25:36
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luweidong401

金虫 (著名写手)

同源模建已经完成,如何进行酶与底物分子的对接呢?所研究的酶分子与模建的酶分子虽然在氨基酸序列上存在同源性,但是作用的底物不同。
3楼2017-10-20 07:37:16
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hclwonder

新虫 (正式写手)

找个对接软件,也有在线服务,就可以做了。不过要做得好就需要经验了。

发自小木虫Android客户端
5楼2017-10-20 18:49:30
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