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蜡笔小case

新虫 (初入文坛)

[求助] 质粒提取问题 已有1人参与

我做了点突,送去测序正确,然后用剩余质粒进行转化然后涂板,菌可以长起来,然后那LB培养基进行摇菌,12个多小时摇不起来菌~你知道要怎么办?

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wrxnyd54

木虫 (著名写手)


必须顶
2楼2017-09-30 12:40:48
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晋鹏

版主 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+4, 鼓励回帖交流 2017-10-01 09:45:47
我觉得有两方面你可以注意下:
1、片断产物有毒,细菌都死掉了。 这是我以前遇到过的情况,过夜摇菌后,第二天可见,细菌聚集成颗粒状,提得质粒浓度很低,后来发现是细菌都死掉了,质粒降解了,所以量很低,可能目的基因所表达的蛋白对细菌有毒,后来我换了一下菌株,使用Xl-blue,提质粒就好了。
2、有无杂菌污染,Amp培养基摇菌时,由于细菌会把Amp抗生素(antibiotic)降解掉,造成抗生浓度降低,后果就是无抗性细菌疯狂生长,原因就是在抗性菌和非抗性菌都能生长的条件下,非抗性菌具有生长优势,另外菌体里含质粒拷贝数低的细菌较高的细菌具有生长优势。所以大提质粒时,要从新鲜平板上挑取单克隆细菌去摇菌,避免杂菌干扰质粒抽提,过夜培养的时间不要过长。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

及时行乐,人生不留遗憾!
3楼2017-09-30 20:13:12
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蜡笔小case

新虫 (初入文坛)

谢谢您,我的质粒是在做点突,所以应该可以排除片段有毒,而且过夜摇菌的培养基很清澈。 现在怀疑是不是板子或者Amp+的问题,真的很疑惑~因为我也是重新用测序正确的质粒重新进行转化,LB也没问题,板子长得也不错, 也确定挑出来菌了。现在很疑惑

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4楼2017-09-30 21:11:02
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蜡笔小case

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 晋鹏 at 2017-09-30 20:13:12
我觉得有两方面你可以注意下:
1、片断产物有毒,细菌都死掉了。 这是我以前遇到过的情况,过夜摇菌后,第二天可见,细菌聚集成颗粒状,提得质粒浓度很低,后来发现是细菌都死掉了,质粒降解了,所以量很低,可能目 ...

谢谢您,我的质粒是在做点突,所以应该可以排除片段有毒,而且过夜摇菌的培养基很清澈。 现在怀疑是不是板子或者Amp+的问题,真的很疑惑~因为我也是重新用测序正确的质粒重新进行转化,LB也没问题,板子长得也不错, 也确定挑出来菌了。现在很疑惑,谢谢您

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5楼2017-09-30 22:25:31
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ULYSSEESWB

铁杆木虫 (正式写手)

抗性失效,抗性加错
6楼2017-10-01 08:47:55
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蜡笔小case

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by ULYSSEESWB at 2017-10-01 08:47:55
抗性失效,抗性加错

我也怀疑

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7楼2017-10-01 19:24:44
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然然家的

新虫 (初入文坛)

8楼2017-10-03 13:26:16
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蜡笔小case

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 然然家的 at 2017-10-03 13:26:16
抗性加的量对不对,

应该是板子的问题

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9楼2017-10-04 10:27:17
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