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樱花崖下

木虫 (小有名气)

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性别: MM
专业: 有机分子功能材料化学

[求助] 高斯基态优化后苯环上多了一个键已有1人参与

哪位好心的大神帮忙解决一下优化问题啊，我用的高斯09版本，分子式进行s0优化的时候，优化完成后，在gaussian view里看s0opt.log文件的结构，发现苯环上突然多了一个键，哪位大神知道怎么回事，小生刚开始学计算，现在一步也进行不下去啊

，下面是我的图，只有C、N、H原子，用的是b3lyp/6-31g*进行的优化

360截图20170907172310617.jpg

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1楼 2017-09-07 17:30:58

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3楼别坑新人可以吗？同意4楼看法。
GV是根据元素半径和原子间距离来判断成键得的，一般来说会不准。
如果gjf文件里面用了geom=connectivity,会在GV打开gjf时候优先采用这个连接关系，但是打开out输出文件时候还是会重新判断连接。

量化计算只依赖于输入文件里面的坐标，几重键什么的不影响最终结果。分子力学计算才需要依赖连接关系。

如果你真的想知道最后形成了几重键，可以用Multiwfn算一下mayer键级。

sob老师离开小木虫，对于后来人真的是一个损失，很大很大的损失。