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kzx_33

金虫 (著名写手)

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[交流] 如何用Hyperchem及Chem3D软件计算一个小分子(如甲苯)的范德华三围?

如何用Hyperchem及Chem3D软件计算一个小分子(如甲苯)的范德华三围?
这两个软件可以做到吗?三围是指:a*b*c(长宽高)各是多少?

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-11-26 at 14:36 ]

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1楼 2009-02-12 18:57:20

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neweroica

木虫 (著名写手)

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专业: 理论和计算化学

★
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主轴问题。将图中分子的位置坐标张量矩阵A进行对角化（一定有解，因为A是个实对称阵），三个特征向量就是分子的三个主轴。三围就是分子在这三个主轴上的尺寸。

另外，从三个特征值上可以看出分子的形状特征：
可以证明（此略），分子的位置张量矩阵A含有三个非负特征值。
当其零特征值的数目分别为3、2、1和0时，分子分别是点状、线状、面状和体状的。
如果位置张量矩阵A的某几个特征值相等，那么分子在相应的这几个方向上的形状也就相同。对于多面体群（如I, Ih, O, Oh, T, Td, Th），三个特征值都相等。

[ Last edited by neweroica on 2009-8-29 at 22:47 ]