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kzx_33

金虫 (著名写手)

[交流] 如何用Hyperchem及Chem3D软件计算一个小分子(如甲苯)的范德华三围?

如何用Hyperchem及Chem3D软件计算一个小分子(如甲苯)的范德华三围?
这两个软件可以做到吗?三围是指:a*b*c(长宽高)各是多少?

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-11-26 at 14:36 ]
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)


xuefei06(金币+1,VIP+0):thanks! 2-13 21:12
这个,呵呵,如果只是要算一个可能容纳分子的盒子,直接打开坐标文件,x,y,z 三个方向上距离一眼就能看出来了,大不了再加上指定原子的 van der Waals 半径即可
4楼2009-02-12 22:18:46
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jghe

金虫 (著名写手)


xuefei06(金币+1,VIP+0):thanks! 2-13 21:13
分子有体积,可以用Hyperchem 错略估计,但你说的三围是指:a*b*c(长宽高) 是什么?分子一般很不规则的
2楼2009-02-12 20:58:41
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kzx_33

金虫 (著名写手)

是指长宽高,虽然分子不规律,但是应该可以计算出最大三个参数的最大值吧,也就是说在每一维上可以求出最大的值(能量最小化后).比如正已烷的长应该是沿六个碳原子方向再加上氢的范德华半径,但是我不知道用软件怎么计算啊
3楼2009-02-12 21:50:20
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kzx_33

金虫 (著名写手)

我的意思就是楼上所说的,能不能具体说说该怎么操作啊?你是用HyperChem吗?我仅了解一些Chem3D的用法.
5楼2009-02-13 09:56:04
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