| 查看: 1356 | 回复: 7 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
［NAMD］利用NAMD模拟拉伸石墨烯 已有4人参与
|
|||
按照教程简单熟悉了NAMD的使用流程，现在想要模拟水平拉伸石墨烯，遇到的问题是共价键无法断裂，如图所示，分别是拉伸开始与结束时的图像。可见石墨烯模型几乎被拉平了，但是共价键还是没有断裂，这似乎不符合实际情况，想要问一下这是什么原因造成的，从什么地方可以设定共价键断裂的条件。本人是初学者，希望各位师兄师姐能够不吝赐教。  发自小木虫Android客户端 |
回复此楼» 猜你喜欢
一志愿重庆大学085700资源与环境总分308求调剂
已经有6人回复
-
268求调剂
已经有7人回复
-
302求调剂
已经有11人回复
-
306求调剂
已经有4人回复
-
材料学学硕080502 337求调剂-一志愿华中科技大学
已经有4人回复
-
求调剂
已经有6人回复
-
313求调剂
已经有3人回复
-
南昌大学材料专硕311分求调剂
已经有6人回复
-
316求调剂
已经有6人回复
-
346求调剂[0856]
已经有7人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
7楼2017-10-31 22:08:51
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
|
力场造成的呀，分子力场拉断，lammps有个距离判断断bond，你也可以这样操作，bond大于某一距离，就断掉，不知道namd有这功能么 发自小木虫Android客户端 |
3楼2017-08-25 15:07:01
4楼2017-08-25 15:18:00
|
我觉得有的，因为我以前看过一篇用NAMD模拟石墨烯拉伸的文章，他那个拉伸到一定程度就出现裂纹了，而我这个像橡皮筋一样，拉伸到60000步都没有断裂的迹象。我在conf文件里设定了cutoff 距离为1.5，但是貌似并没有起到作用。 发自小木虫Android客户端 |
5楼2017-08-25 16:21:03
