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921293056

银虫 (初入文坛)

[交流] PCR、琼脂糖凝胶电泳

电泳PCR技术核酸技术
PCR总也扩不出条带,到底是引物问题还是模板问题?求高手指点
最近做细菌DNA的PCR,条带总也不出来,有时候连二聚体都没有,单独用引物跑电泳,结果引物没有跑出条带,(如图一),用的是1.5的胶,中间是(100bpmarker),后来又重新用2.0的胶又做了一次,还是没有条带。还做了同一个模板温度梯度的PCR(从56到68度),Tm值分别为54.9,63.6(图二),目的片段大小左边是198bp,右边是158bp。感觉左边像是二聚体,右边也不对,左边第五条带感觉像是目的片段。PCR条件是94度预变性3分,94度变性30秒,56到68退火30秒,72度延伸一分钟。因为感觉左边第五条像一条目的片段。然后再次重新换模板验证第五条带的温度时是否为目的片段,2号和8号是可疑温度,两管是不同的模板,结果出来的图如图三,左边的条带不见了。加的体系及退火温度一致,却没有条带,泳道12号是另外一种菌目标片段大小158bp,但是目的条带很暗,左边也有些很暗的条带,不知道是什么。回来用提取的总DNA去跑电泳,结果如图四,各位大师们,有遇到同样的情况吗?求高手指点迷津,在此先谢谢大家了

PCR、琼脂糖凝胶电泳


PCR、琼脂糖凝胶电泳-1


PCR、琼脂糖凝胶电泳-2


PCR、琼脂糖凝胶电泳-3


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921293056

银虫 (初入文坛)

第四张图和第二张图换个位置,

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2楼2017-07-16 15:27:33
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蜗牛二世

铁杆木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-07-19 07:43:15
引物都没条带,那只好先怀疑引物的问题咯,可能你的引物根本就没有合成,你拿到的就是一个空管.....

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静心 心静
3楼2017-07-16 23:30:34
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921293056

银虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 蜗牛二世 at 2017-07-16 23:30:34
引物都没条带,那只好先怀疑引物的问题咯,可能你的引物根本就没有合成,你拿到的就是一个空管.....

我的引物是公司给配好的10uM的,这个引物公司还可以,身边有人用的。今天又试着减少引物量,增加模板量,同时减少循环次数,退火温度也降低了一些,然后的条带如下图。左后一排应该就是我的目的条带。但是左边的那四个是一种细菌,但是还是二聚体。明天再优化
PCR、琼脂糖凝胶电泳-4



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4楼2017-07-17 21:06:04
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921293056

银虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by 921293056 at 2017-07-17 21:06:04
我的引物是公司给配好的10uM的,这个引物公司还可以,身边有人用的。今天又试着减少引物量,增加模板量,同时减少循环次数,退火温度也降低了一些,然后的条带如下图。左后一排应该就是我的目的条带。但是左边的那 ...

引物确实是有问题。右边的今天条带不错

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5楼2017-07-19 00:38:45
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蜗牛二世

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 921293056 at 2017-07-19 00:38:45
引物确实是有问题。右边的今天条带不错
...

重新换引物了?
静心 心静
6楼2017-07-19 18:36:36
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921293056

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 蜗牛二世 at 2017-07-19 18:36:36
重新换引物了?...

换了,引物还在路上。

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7楼2017-07-20 20:26:28
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