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我做的材料是多倍体，做了ssr分型后，三倍体有一至三个峰值，二倍体有一至两个峰值，在数据处理格式上怎么统一起来，有没有大神知道 发自小木虫IOS客户端 |
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晋鹏
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2017-07-16 23:18:31
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西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2017-07-16 23:18:31
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1、应该首先确定引物在你检测的群体中一共有多少互异的条带：即有多少不同的等位变异，如果你是人工读带，就是在不同泳道上一共有多少不同迁移距离的条带。 2、二倍体的条带判读你只要记录最下面（最黑、最明显的那个条带）的变化类型即可（若最下面的条带有两条且一样黑，那就是杂合），其他条带可以全部视而不见，因为那些条带要不然是非特异扩增，要不然是taq酶合成滑动所致，不用考虑。 3、因为SSR是共显性标记，加之你研究的是二倍体作物，所以建议你还是按分子量重新读带，或是1,2,3,4..重新命名不同迁移距离的带型。 |
2楼2017-07-16 08:20:07
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不是电泳，是STR分型，没有条带，分型读数按峰值来的，是二倍体和三倍体都有，主要是三倍体与二倍体放在一起的时候在进行数据整理，就不知道应该用什么格式了，放GenAlex分析 发自小木虫IOS客户端 |
3楼2017-07-16 18:43:33