| 查看: 1419 | 回复: 2 | |||
[求助]
ssr数据分析求助 已有1人参与
|
|
我做的材料是多倍体，做了ssr分型后，三倍体有一至三个峰值，二倍体有一至两个峰值，在数据处理格式上怎么统一起来，有没有大神知道 发自小木虫IOS客户端 |
回复此楼» 猜你喜欢
筑牢营养安全线：以精准检测，护健康基石
已经有0人回复
-
推荐一些20种氨基酸检测的实际应用案例
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有180人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
晋鹏
版主 (知名作家)
- MolEPI: 6
- 应助: 626 (博士)
- 贵宾: 0.096
- 金币: 27590.2
- 散金: 1052
- 红花: 288
- 沙发: 2
- 帖子: 5663
- 在线: 726.4小时
- 虫号: 1183978
- 注册: 2011-01-05
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
- 管辖: 农林
【答案】应助回帖
★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2017-07-16 23:18:31
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2017-07-16 23:18:31
|
1、应该首先确定引物在你检测的群体中一共有多少互异的条带：即有多少不同的等位变异，如果你是人工读带，就是在不同泳道上一共有多少不同迁移距离的条带。 2、二倍体的条带判读你只要记录最下面（最黑、最明显的那个条带）的变化类型即可（若最下面的条带有两条且一样黑，那就是杂合），其他条带可以全部视而不见，因为那些条带要不然是非特异扩增，要不然是taq酶合成滑动所致，不用考虑。 3、因为SSR是共显性标记，加之你研究的是二倍体作物，所以建议你还是按分子量重新读带，或是1,2,3,4..重新命名不同迁移距离的带型。 |
2楼2017-07-16 08:20:07
|
不是电泳，是STR分型，没有条带，分型读数按峰值来的，是二倍体和三倍体都有，主要是三倍体与二倍体放在一起的时候在进行数据整理，就不知道应该用什么格式了，放GenAlex分析 发自小木虫IOS客户端 |
3楼2017-07-16 18:43:33