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天宇201266

金虫 (正式写手)

[求助] 不对称PCR扩增出单链DNA后,胶回收浓度很低 已有2人参与

最近做不对称PCR扩增单链DNA,不对称PCR产物经琼脂糖凝胶电泳回收后,浓度很低,这是为什么?求大神指导,单链DNA是被降解了吗?还是因为自己所有的试剂盒不行,自己用的试剂盒是天根胶回收试剂盒,求指导!!!
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在路上。。。
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晋鹏

版主 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
天宇201266: 金币+2 2017-07-13 08:06:09
1、其实DNA浓度低也不是就不能用,你只要上1ul跑电泳能看见条带就行了。浓度低连接时可以扩大体系,用20-30ul体系,不加水了,全用DNA补齐,连接酶也多加。


2、如果试剂盒没问题的话,考虑一下片段大小。如果太小的话(500bp或以下), 加入结合液后,向其中再加入1/3体积的异丙醇,然后按操作说明书操作。溶胶一定要非常仔细,并且彻底!溶胶以后,注意体系的pH值,如果pH值太高,也会影响回收。


3、简单点的就是用胶回收盒子里面的柱子重新富集一遍。加大PCR产物。我一般都是做50ul体系,做几个,跑胶后,切胶一起回收,电泳检测浓度。
及时行乐,人生不留遗憾!
2楼2017-07-11 08:33:35
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elmanbio

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

没有必要测浓度,试剂盒中的盐分高,影响吸光度,直接电泳检测
3楼2018-01-05 17:10:48
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qinshouhudie

新虫 (初入文坛)

不对称pcr引物设计需要注意啥总是扩不出单链

发自小木虫IOS客户端
4楼2021-10-31 08:18:40
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