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CMA17

新虫 (初入文坛)

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[求助] 高分子模板剂诱导晶体生长的模拟

目前有实验数据证明高分子模板剂可以诱导晶体按照一个方向生长，现在想要用MS来模拟一下这个过程，请问模拟过程要怎样设计一下？或者有相关文献推荐也非常感谢。还请前辈指导

。
PS：目前金币较少，我马上跟别人借点金币过来补充。

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1楼 2017-06-17 11:16:15

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CMA17

新虫 (初入文坛)

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引用回帖:

8楼: Originally posted by clickme at 2017-06-20 16:46:08
好的，我明白你的意思了。
1. 我之前说的零点能校正是对应与量子化学计算方法需要考虑的问题，你用MD的话就可以不用考虑了。
2. 我用的是MS2017，我看了下Forcite模块（新版中Discover与Forcite合并和），没有声 ...

谢谢您的指导！

目前我做模拟计算的过程是：1、晶体切面，在Discover中加力场；2、固定下层原子，在Discover中进行Minimizer，构建超胞并加真空层；3、构建高分子，在Forcite中进行结构优化；4、将高分子放在晶体表面，固定晶体所有原子，进行动力学计算；5、最后能量计算。

是不是要改成：1、晶体切面，在Discover中加力场；2、固定下层原子，在Discover中进行Minimizer，构建超胞并加真空层；3、构建高分子，在Forcite中进行结构优化；4、将高分子放在晶体表面，固定晶体所有原子，将整个结构在Forcite中进行结构优化；5、将整个结构进行动力学计算；6、最后能量计算。

修改后的计算过程我有2个问题：1、将整个结构进行结构优化的过程并没有加入温度场，这样是否能满足温度涨落导致的形变能的计算。在目前的计算过程中，动力学计算过程未固定高分子，且计算过程中有温度参与，是否已经包括温度造成的分子形变能；2、动力学计算之前将整个体系进行结构优化，当不同晶面吸附同一高分子时，由于晶面结构不同，结构优化后的高分子在不同晶面上的结构一定不同，这样的两个体系算出的吸附能是否有可比性。就是说，进行动力学计算的高分子组成不变但构型不同，这样得到的吸附能能不能算同高分子对晶体不同晶面的吸附能？

问题比较多，期待您的再次耐心指导，谢谢

！