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CMA17

新虫 (初入文坛)

[求助] 高分子模板剂诱导晶体生长的模拟

目前有实验数据证明高分子模板剂可以诱导晶体按照一个方向生长,现在想要用MS来模拟一下这个过程,请问模拟过程要怎样设计一下?或者有相关文献推荐也非常感谢。还请前辈指导
PS:目前金币较少,我马上跟别人借点金币过来补充。
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CMA17

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by clickme at 2017-06-20 16:46:08
好的,我明白你的意思了。
1. 我之前说的零点能校正是对应与量子化学计算方法需要考虑的问题,你用MD的话就可以不用考虑了。
2. 我用的是MS2017, 我看了下Forcite模块(新版中Discover与Forcite合并和),没有声 ...

谢谢您的指导!

目前我做模拟计算的过程是:1、晶体切面,在Discover中加力场;2、固定下层原子,在Discover中进行Minimizer,构建超胞并加真空层;3、构建高分子,在Forcite中进行结构优化;4、将高分子放在晶体表面,固定晶体所有原子,进行动力学计算;5、最后能量计算。

是不是要改成:1、晶体切面,在Discover中加力场;2、固定下层原子,在Discover中进行Minimizer,构建超胞并加真空层;3、构建高分子,在Forcite中进行结构优化;4、将高分子放在晶体表面,固定晶体所有原子,将整个结构在Forcite中进行结构优化;5、将整个结构进行动力学计算;6、最后能量计算。

修改后的计算过程我有2个问题:1、将整个结构进行结构优化的过程并没有加入温度场,这样是否能满足温度涨落导致的形变能的计算。在目前的计算过程中,动力学计算过程未固定高分子,且计算过程中有温度参与,是否已经包括温度造成的分子形变能;2、动力学计算之前将整个体系进行结构优化,当不同晶面吸附同一高分子时,由于晶面结构不同,结构优化后的高分子在不同晶面上的结构一定不同,这样的两个体系算出的吸附能是否有可比性。就是说,进行动力学计算的高分子组成不变但构型不同,这样得到的吸附能能不能算同高分子对晶体不同晶面的吸附能?

问题比较多,期待您的再次耐心指导,谢谢
9楼2017-06-21 10:12:19
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clickme

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
CMA17: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2017-06-19 08:41:29
计算模板剂在不同晶面上的吸附能差异。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
2楼2017-06-18 18:06:41
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CMA17

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by clickme at 2017-06-18 18:06:41
计算模板剂在不同晶面上的吸附能差异。

谢谢您的回复。我确实也是这么做了,但是老觉得写在文章里,这个过程跟实验数据分析是反着的。您那边有符合得比较好的文献吗?我可能关键词搜错了并没有找到关于模板剂诱导晶体生长的文献,只是找到了一些与我的晶体相同的,不同高分子吸附的文献。很期待您的指导
3楼2017-06-19 08:50:23
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clickme

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
CMA17: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2017-06-20 10:30:21
如果可以的话做一下频率分析,得到零点能和室温下的热矫正,可能你的结论就能正过来了。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2017-06-19 12:11:30
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