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doctorhuke

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何纯化PCR产物做Infusion cloning 已有1人参与

本人最近在做infusion cloning,有5个片段,1k-3k之间,用PHusion polymerase做PCR,可以扩增出单条的目的片段,共有100ul反应体积的产物,于是我用MB的GENEclean试剂盒直接对PCR产物进行提纯,得到的产物20ul。为了达到In fusion的要求,于是用nanodrop测浓度,看见吸收峰在245左右,与正常DNA形态差异较大,260/280为2.04。怕不纯,同样条件PCR,得到100ul体积的反应产物,跑胶后,用QIGEN的DNA extractions kit提DNA,得到30ul纯化产物,同样用nanodrop检测浓度,只有30ng/ul,且吸收峰在230,260/280为3.几,高的离奇。检索网上资料,说是有EDTA或者盐污染才会出现这种情况。于是多次重复,仍然得到类似结果。反复核实实验步骤无问题。本人也做过两年的分子试验,但从未测过PCR产物的纯度和浓度,但割胶提纯的DNA用于下游的克隆试验从来没有问题。这次做infusion克隆,因为protocol对片段和载体的浓度有要求,加上本人第一次做infusion克隆,怕DNA片段不纯,加上浓度没有预想中的高,不满足infusion的反应要求,不敢继续做下去。这样来回已经搞了两周了,没有一点进展。快崩溃了。不知坛子里的高人能否给些建议。多谢多谢。

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hzau103

新虫 (正式写手)

2楼2017-06-03 16:25:23
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吕玉平

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-07-29 12:04:33
接着向下做,不能一味追求OD值的,机器也可能会出现不同程度的误差,只要是电泳跑出来了,条带量且单条带一般是没有问题的。
每天的目标就是过的充实
3楼2017-06-12 16:25:49
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wei643478633

新虫 (初入文坛)

想请问一下现在做出来了吗?我最近也在做infusion连接,就是连不上,想请教一下经验

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4楼2017-06-14 18:57:47
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矮腿妹的烦恼

新虫 (初入文坛)

请教一下做出来了吗?一次性连接五个片段,最近连接四个片段不能做出来

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5楼2017-07-28 22:12:34
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