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linzi610

新虫 (初入文坛)

[求助] 请问lammps高手,自己编译的lammps如何用mpirun单机多核运行? 已有1人参与

   我自己在ubuntu下编译lammps已经超过几十次上百次了,但是至今仍然没有找到多核并行运行的方法.如果是直接从网上下载的lammps,就可以用mpirun多核并行运行.以前由于用gpu加速,不需要cpu的多核运行,所以这个问题就一直没有去解决;但是现在换到在安卓手机上运行lammps,直接输出mpg视频查看结果,不可能使用gpu加速,所以cpu多核运行变得十分重要.我自己已经尝试了很多天了,仍然没有一点头绪,无论是改变编译宏选项还是改变package组件都无效;mpirun可以启动一般程序的任意多个的进程,但是只要换成自己编译的lammps程序,无论如何就都只有一个进程了,所以cpu无论多少核就只有一个核在运行lammps.如果谁帮我解决这个问题,我把我所有的分都给他,否则请版主扣掉我所有的分.谢谢.
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linzi610

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by jluchemlib at 2017-05-31 08:31:21
先装任何一个mpi软件,比如openmpi,装好之后在bashrc里设置环境变量,然后下载lammps源代码,进src里面打make mpi就可以了

我问的不是怎样编译lammps,我已经在ubuntu下编译过无数遍了,包括编译GPU和CUDA的包和对多种显卡的支持.问题是自己编译的lammps只能用mpirun启动一个进程所以无法cpu多核运行,但是从网上下载的就可以多核运行.手机和电脑上好像mpich2和openmpi都装上了,不知道是不是两者冲突导致的.openmpi我的没有设置什么,可能是系统自带的.
6楼2017-05-31 10:45:19
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哦紧迫看

新虫 (初入文坛)

2楼2017-05-28 23:42:53
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linzi610

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 哦紧迫看 at 2017-05-28 23:42:53
安卓手机运行lammps?

安卓的终端模拟器chroot运行ubuntu,我已经用了好几年了.
3楼2017-05-30 00:07:10
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linzi610

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 哦紧迫看 at 2017-05-28 23:42:53
安卓手机运行lammps?

因为用apt-get 下载的arm版的lammps版本比较老,而且不支持视频dump输出,所以只能自己编译的才行.无论是在电脑上还是在手机上,这个自己编译的无法多核运行的问题都一直存在着,我花了大量时间都没有解决这问题.
4楼2017-05-30 00:11:33
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