应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 请问lammps高手，自己编译的lammps如何用mpirun单机多核运行？
111/2返回列表12下一页
查看: 4018  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

linzi610

新虫 (初入文坛)

[求助] 请问lammps高手，自己编译的lammps如何用mpirun单机多核运行？ 已有1人参与

　　　我自己在ubuntu下编译lammps已经超过几十次上百次了，但是至今仍然没有找到多核并行运行的方法．如果是直接从网上下载的lammps，就可以用mpirun多核并行运行．以前由于用gpu加速，不需要cpu的多核运行，所以这个问题就一直没有去解决；但是现在换到在安卓手机上运行lammps，直接输出mpg视频查看结果，不可能使用gpu加速，所以cpu多核运行变得十分重要．我自己已经尝试了很多天了，仍然没有一点头绪，无论是改变编译宏选项还是改变package组件都无效；mpirun可以启动一般程序的任意多个的进程，但是只要换成自己编译的lammps程序，无论如何就都只有一个进程了，所以cpu无论多少核就只有一个核在运行lammps．如果谁帮我解决这个问题，我把我所有的分都给他，否则请版主扣掉我所有的分．谢谢．
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2017-05-28 21:20:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

哦紧迫看

新虫 (初入文坛)
安卓手机运行lammps？

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
2楼2017-05-28 23:42:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

linzi610

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 哦紧迫看 at 2017-05-28 23:42:53
安卓手机运行lammps？

安卓的终端模拟器chroot运行ubuntu，我已经用了好几年了．
赞一下 回复此楼
3楼2017-05-30 00:07:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

linzi610

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 哦紧迫看 at 2017-05-28 23:42:53
安卓手机运行lammps？

因为用apt-get 下载的arm版的lammps版本比较老，而且不支持视频dump输出，所以只能自己编译的才行．无论是在电脑上还是在手机上，这个自己编译的无法多核运行的问题都一直存在着，我花了大量时间都没有解决这问题．
赞一下 回复此楼
4楼2017-05-30 00:11:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jluchemlib

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
linzi610: 金币+5, ★★★很有帮助, 问题解决了，如果不是这位提示，我很久都找不到方向，实在是千头万绪． 2017-05-31 15:18:15
先装任何一个mpi软件，比如openmpi，装好之后在bashrc里设置环境变量，然后下载lammps源代码，进src里面打make mpi就可以了
赞一下 回复此楼
5楼2017-05-31 08:31:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

linzi610

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by jluchemlib at 2017-05-31 08:31:21
先装任何一个mpi软件，比如openmpi，装好之后在bashrc里设置环境变量，然后下载lammps源代码，进src里面打make mpi就可以了

我问的不是怎样编译lammps，我已经在ubuntu下编译过无数遍了，包括编译GPU和CUDA的包和对多种显卡的支持．问题是自己编译的lammps只能用mpirun启动一个进程所以无法cpu多核运行，但是从网上下载的就可以多核运行．手机和电脑上好像mpich2和openmpi都装上了，不知道是不是两者冲突导致的．openmpi我的没有设置什么，可能是系统自带的．
赞一下 回复此楼
6楼2017-05-31 10:45:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mengfan

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by jluchemlib at 2017-05-31 08:31:21
先装任何一个mpi软件，比如openmpi，装好之后在bashrc里设置环境变量，然后下载lammps源代码，进src里面打make mpi就可以了

应该就是这样啊。并行计算的编译并不难。不过反馈一个信息，我之前用Ubuntu, 开始可以用多线程计算，后来无论mpirun设置用几个线程，最后只能用一个。原因至今不清楚。

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
XeTaL
7楼2017-05-31 11:07:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

linzi610

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by jluchemlib at 2017-05-31 08:31:21
先装任何一个mpi软件，比如openmpi，装好之后在bashrc里设置环境变量，然后下载lammps源代码，进src里面打make mpi就可以了

我发现我的ubuntu里的mpirun是用apt-get安装lammps时装上的libopenmpi里面的，而不是mpich2里面的．可能存在版本冲突问题．
赞一下 回复此楼
8楼2017-05-31 11:08:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

linzi610

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by mengfan at 2017-05-31 11:07:35
应该就是这样啊。并行计算的编译并不难。不过反馈一个信息，我之前用Ubuntu, 开始可以用多线程计算，后来无论mpirun设置用几个线程，最后只能用一个。原因至今不清楚。
...

我一直用的都是并行编译，自己编译的lammps只能用一个线程的原因就是mpirun只能启动它的一个进程．你用几行c语言代码写一个长时间循环语句的小程序，都可以用mpirun启动它的任意多个进程，用top命令就可以看得出来，用网上下载的lammps程序也可以，但是只要换成自己编译的lammps程序，mpirun就无论如何只能启动它一个进程，所以只能使用单核．估计可能是openmpi的问题．
赞一下 回复此楼
9楼2017-05-31 13:21:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jluchemlib

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by linzi610 at 2017-05-31 10:45:19
我问的不是怎样编译lammps，我已经在ubuntu下编译过无数遍了，包括编译GPU和CUDA的包和对多种显卡的支持．问题是自己编译的lammps只能用mpirun启动一个进程所以无法cpu多核运行，但是从网上下载的就可以多核运行． ...

只要你的openmpi或者mpich2是从官网上下源码包安装的，就没问题。你装lammps的时候想用哪个就调用哪个就可以了。觉得装这种软件还是不要用ubuntu自带的apt-get比较好
赞一下 回复此楼
10楼2017-05-31 15:08:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 linzi610 的主题更新
111/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 306求调剂 +5 来好运来来来 2026-03-22 5/250 2026-03-22 16:17 by BruceLiu320
[考研] 298求调剂 +5 上岸6666@ 2026-03-20 5/250 2026-03-22 15:46 by ColorlessPI
[考研] 一志愿北京化工大学 070300 学硕 336分 求调剂 +3 vv迷 2026-03-22 3/150 2026-03-22 15:18 by 杨杨杨紫
[考研] 070300化学求调剂 +3 苑豆豆 2026-03-20 3/150 2026-03-22 14:48 by ColorlessPI
[考研] 384求调剂 +3 子系博 2026-03-22 4/200 2026-03-22 11:04 by 搏击518
[考研] 一志愿华中科技大学071000，求调剂 +4 沿岸有贝壳6 2026-03-21 4/200 2026-03-22 07:21 by ilovexiaobin
[考研] 工科0856求调剂 +3 沐析汀汀 2026-03-21 3/150 2026-03-21 18:30 by 学员8dgXkO
[考研] 材料学硕333求调剂 +3 北道巷 2026-03-18 3/150 2026-03-21 18:17 by 学员8dgXkO
[考研] 297求调剂 +11 戏精丹丹丹 2026-03-17 12/600 2026-03-21 17:47 by ColorlessPI
[考研] 材料 271求调剂 +5 展信悦_ 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:29 by 学员8dgXkO
[考研] 材料与化工（0856）304求 B区 调剂 +3 邱gl 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:47 by lature00
[考研] 310求调剂 +3 baibai1314 2026-03-16 3/150 2026-03-21 03:56 by JourneyLucky
[考研] 301求调剂 +10 yy要上岸呀 2026-03-17 10/500 2026-03-21 03:14 by JourneyLucky
[考研] 307求调剂 +10 冷笙123 2026-03-17 10/500 2026-03-21 01:54 by JourneyLucky
[考研] 药学383 求调剂 +3 药学chy 2026-03-15 5/250 2026-03-20 22:11 by 云游重阳
[考研] 求调剂 +3 @taotao 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:35 by JourneyLucky
[考研] 08工学调剂 +5 用户573181 2026-03-20 5/250 2026-03-20 15:47 by xia_2003
[论文投稿] 申请回稿延期一个月，编辑同意了。但系统上的时间没变，给编辑又写邮件了，没回复 10+3 wangf9518 2026-03-17 4/200 2026-03-19 23:55 by babero
[考研] 301求调剂 +4 A_JiXing 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:32 by ruiyingmiao
[考研] 308求调剂 +4 是Lupa啊 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:12 by ruiyingmiao
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭