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linzi610

新虫 (初入文坛)

[求助] 请问lammps高手,自己编译的lammps如何用mpirun单机多核运行? 已有1人参与

   我自己在ubuntu下编译lammps已经超过几十次上百次了,但是至今仍然没有找到多核并行运行的方法.如果是直接从网上下载的lammps,就可以用mpirun多核并行运行.以前由于用gpu加速,不需要cpu的多核运行,所以这个问题就一直没有去解决;但是现在换到在安卓手机上运行lammps,直接输出mpg视频查看结果,不可能使用gpu加速,所以cpu多核运行变得十分重要.我自己已经尝试了很多天了,仍然没有一点头绪,无论是改变编译宏选项还是改变package组件都无效;mpirun可以启动一般程序的任意多个的进程,但是只要换成自己编译的lammps程序,无论如何就都只有一个进程了,所以cpu无论多少核就只有一个核在运行lammps.如果谁帮我解决这个问题,我把我所有的分都给他,否则请版主扣掉我所有的分.谢谢.
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linzi610

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by mengfan at 2017-05-31 11:07:35
应该就是这样啊。并行计算的编译并不难。不过反馈一个信息,我之前用Ubuntu, 开始可以用多线程计算,后来无论mpirun设置用几个线程,最后只能用一个。原因至今不清楚。
...

我一直用的都是并行编译,自己编译的lammps只能用一个线程的原因就是mpirun只能启动它的一个进程.你用几行c语言代码写一个长时间循环语句的小程序,都可以用mpirun启动它的任意多个进程,用top命令就可以看得出来,用网上下载的lammps程序也可以,但是只要换成自己编译的lammps程序,mpirun就无论如何只能启动它一个进程,所以只能使用单核.估计可能是openmpi的问题.
9楼2017-05-31 13:21:37
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哦紧迫看

新虫 (初入文坛)

2楼2017-05-28 23:42:53
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linzi610

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 哦紧迫看 at 2017-05-28 23:42:53
安卓手机运行lammps?

安卓的终端模拟器chroot运行ubuntu,我已经用了好几年了.
3楼2017-05-30 00:07:10
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linzi610

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 哦紧迫看 at 2017-05-28 23:42:53
安卓手机运行lammps?

因为用apt-get 下载的arm版的lammps版本比较老,而且不支持视频dump输出,所以只能自己编译的才行.无论是在电脑上还是在手机上,这个自己编译的无法多核运行的问题都一直存在着,我花了大量时间都没有解决这问题.
4楼2017-05-30 00:11:33
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