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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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新虫 (小有名气)

[求助] Autodock!求救!!

想找一个Stevioside(甜菊糖)的小分子作为受体,在pubchem上只发现有2D结构式,转成.pdb后根本对接不了,尝试用Chemsketch重新作图再转3D,无奈手残。所以,拜托了!!!请给我一个Stevioside的3D结构文件吧!!!!!!
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1215216349

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by mddock at 2017-04-19 11:22:32
Chemsketch的结构图直接导入对接软件。

谢谢,解决了。可不可以请教一下,autodock的模拟结果怎么样可以用pymol观察啊,autodock上点击就报错。
Nice to meet you!
3楼2017-04-21 12:09:07
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mddock

新虫 (小有名气)

Chemsketch的结构图直接导入对接软件。

发自小木虫Android客户端
2楼2017-04-19 11:22:32
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宋雷宋雷

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 1215216349 at 2017-04-21 12:09:07
谢谢,解决了。可不可以请教一下,autodock的模拟结果怎么样可以用pymol观察啊,autodock上点击就报错。...

您好,请问您怎么做的小分子PDB格式啊?可不可以跟我说一下 ,我下载的mol2格式转成PDB,对接不成功,最后run Autogrid 跟Autodock 时出现Fatal errors :errors in readmap  ,是怎么一回事啊 而且不能生成NA MAP文件,求解???在下新手上路 ,求赐教。
4楼2018-03-18 15:25:43
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