应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » Autodock！求救！！
41/1返回列表
查看: 996  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

1215216349

新虫 (小有名气)

[求助] Autodock！求救！！

想找一个Stevioside（甜菊糖）的小分子作为受体，在pubchem上只发现有2D结构式，转成.pdb后根本对接不了，尝试用Chemsketch重新作图再转3D，无奈手残。所以，拜托了！！！请给我一个Stevioside的3D结构文件吧！！！！！！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
Nice to meet you!
1楼 2017-04-19 11:13:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mddock

新虫 (小有名气)
Chemsketch的结构图直接导入对接软件。

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
2楼2017-04-19 11:22:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

1215216349

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by mddock at 2017-04-19 11:22:32
Chemsketch的结构图直接导入对接软件。

谢谢，解决了。可不可以请教一下，autodock的模拟结果怎么样可以用pymol观察啊，autodock上点击就报错。
赞一下 回复此楼
Nice to meet you!
3楼2017-04-21 12:09:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

宋雷宋雷

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 1215216349 at 2017-04-21 12:09:07
谢谢，解决了。可不可以请教一下，autodock的模拟结果怎么样可以用pymol观察啊，autodock上点击就报错。...

您好，请问您怎么做的小分子PDB格式啊？可不可以跟我说一下 ，我下载的mol2格式转成PDB，对接不成功，最后run Autogrid 跟Autodock 时出现Fatal errors ：errors in readmap  ，是怎么一回事啊 而且不能生成NA MAP文件，求解？？？在下新手上路 ，求赐教。
赞一下 回复此楼
4楼2018-03-18 15:25:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 1215216349 的主题更新
41/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的？ +15 爱看书的可乐 2026-08-26 17/850 2026-08-28 01:23 by xxniao123
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难 +9 Kittylucky 2026-08-27 9/450 2026-08-28 01:08 by jurkat.1640
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜？ 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 LIbGuocjEEYw 2026-08-26 4/200 2026-08-27 02:01 by Ie9AyIAvGbvs
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 系统查不到 +10 董八千 2026-08-26 10/500 2026-08-26 16:30 by Equinoxhua
[基金申请] 怎么查啊 +5 huang1991js 2026-08-26 5/250 2026-08-26 16:09 by Equinoxhua
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件，有关系吗？ +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 今天务委会开完了，明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭