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1215216349

新虫 (小有名气)

[求助] Autodock！求救！！

想找一个Stevioside（甜菊糖）的小分子作为受体，在pubchem上只发现有2D结构式，转成.pdb后根本对接不了，尝试用Chemsketch重新作图再转3D，无奈手残。所以，拜托了！！！请给我一个Stevioside的3D结构文件吧！！！！！！
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Nice to meet you!
1楼 2017-04-19 11:13:06
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mddock

新虫 (小有名气)
Chemsketch的结构图直接导入对接软件。

发自小木虫Android客户端
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2楼2017-04-19 11:22:32
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1215216349

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by mddock at 2017-04-19 11:22:32
Chemsketch的结构图直接导入对接软件。

谢谢，解决了。可不可以请教一下，autodock的模拟结果怎么样可以用pymol观察啊，autodock上点击就报错。
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Nice to meet you!
3楼2017-04-21 12:09:07
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宋雷宋雷

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 1215216349 at 2017-04-21 12:09:07
谢谢，解决了。可不可以请教一下，autodock的模拟结果怎么样可以用pymol观察啊，autodock上点击就报错。...

您好，请问您怎么做的小分子PDB格式啊？可不可以跟我说一下 ，我下载的mol2格式转成PDB，对接不成功，最后run Autogrid 跟Autodock 时出现Fatal errors ：errors in readmap  ，是怎么一回事啊 而且不能生成NA MAP文件，求解？？？在下新手上路 ，求赐教。
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4楼2018-03-18 15:25:43
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