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史银婷

新虫 (小有名气)

[求助] 中间产物和过渡态的优化 已有1人参与

计算O3和CH2自由基的反应机理！中间产物优化完成了，但是过渡态算了几遍都不行！想知道过渡态分子构形与中间产物的分子构形差别大么，该怎么算呢？万分感谢！今天才注册的小虫，所以金币不多，不好意思了！

中间产物和过渡态的优化


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1楼 2017-04-14 17:43:04
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建建爱乖乖

金虫 (小有名气)
1. 你应该了解你这个反应的大致过程，知道中间产物和过渡态的大致结构。2. 如果你对你的反应过渡态结构非常有把握，可以用opt(ts)来优化并做振动分析；如果没有把握，可以用opt(qst2)或者opt(qst3)进行优化并做振动分析验证。qst2和qst3区别在与输入文件给出的是反应物和生成物，反应物、生成物和过渡态猜测结构。这个G09 手册上都有。如果你自己都不知道过渡态分子构型和中间产物的分子构型差别大不大，那可能没人能帮得了你了，这个得自己学。
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2楼2017-04-15 11:01:59
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18235149572

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
如果你的中间产物是正确的，就用qst2来找过渡态，以反应物和中间产物做为qst2的反应物和产物，输入文件时保证原子标号一致。我也是刚做过两个月的过渡态。
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小小白！
3楼2017-04-17 11:39:03
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史银婷

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 建建爱乖乖 at 2017-04-15 11:01:59
1. 你应该了解你这个反应的大致过程，知道中间产物和过渡态的大致结构。2. 如果你对你的反应过渡态结构非常有把握，可以用opt(ts)来优化并做振动分析；如果没有把握，可以用opt(qst2)或者opt(qst3)进行优化并做振动 ...

谢谢啊 刚看到回复  灰常感谢

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4楼2017-04-20 16:42:14
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史银婷

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 18235149572 at 2017-04-17 11:39:03
如果你的中间产物是正确的，就用qst2来找过渡态，以反应物和中间产物做为qst2的反应物和产物，输入文件时保证原子标号一致。我也是刚做过两个月的过渡态。

中间产物应该是正确的吧 老师说直接在中间产物的基础上只改键长键角 把命令opt改成opt=ts  算！ 就是算不出来

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5楼2017-04-20 16:44:21
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18235149572

新虫 (小有名气)
加其他关键词了吗？比如：opt=noeigen,calcall 这样比较耗时间

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小小白！
6楼2017-04-20 17:35:09
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