应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » LiH+NH3BH3的过渡态，快崩溃了
151/1返回列表
查看: 1742  |  回复: 14
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

Trouton

新虫 (小有名气)

[交流] LiH+NH3BH3的过渡态，快崩溃了

做Li-H和H-NH2-BH3的脱氢反应的过渡态，涉及到四个原子之间，Li-H键长变长，N-H键键长变长，H-H结合形成产物，Li与NH2BH3靠近形成产物。我逐步变化这四个键的键长，找到能量最高点，分别用QST3和opt=ts去做过渡态，都无法得到正确的结果。opt=TS直接导致部分原子跑偏，中间就died了。
我把QST3的输入文件贴上来，求高手帮我分析分析，不胜感激啊。
ps：因为有实验结构的数据，我固定了部分化学键，如果直接全优化与实际偏差太远，不知道这样行不行。

%chk=LiH+AB-ts.chk
%mem=100MW
%nproc=4
# opt=(qst3,modredundant) freq=noraman rhf/sto-3g guess=read

LiH+AB-start

0 1
N
H                  1              B1
B                  1              B2    2              A1
H                  3              B3    1              A2    2              D1
H                  3              B4    1              A3    2              D2
H                  3              B5    1              A4    2              D3
H                  1              B6    3              A5    4              D4
H                  1              B7    3              A6    4              D5
Li                 1              B8    3              A7    4              D6
H                  9              B9    1              A8    3              D7

   B1             1.02499939
   B2             1.56000039
   B3             1.16202710
   B4             1.18800014
   B5             1.16441094
   B6             1.02500027
   B7             1.22500000
   B8             2.33000021
   B9             1.76000000
   A1           110.52347323
   A2           107.40909414
   A3           104.15346263
   A4           107.38004545
   A5           109.82733557
   A6           112.88463415
   A7           112.99961494
   A8            56.78205258
   D1          -169.98332784
   D2            70.75227411
   D3           -47.59079699
   D4           -58.01798895
   D5            26.73232224
   D6           111.42284052
   D7          -112.76888247

1 3 1.560000 F
1 7 1.025000 F
1 2 1.025000 F
9 1 3 113.000000 F

LiH+AB-ts

0 1
N
H                  1              B1
B                  1              B2    2              A1
H                  3              B3    1              A2    2              D1
H                  3              B4    1              A3    2              D2
H                  3              B5    1              A4    2              D3
H                  1              B6    3              A5    4              D4
H                  1              B7    3              A6    4              D5
Li                 1              B8    3              A7    4              D6
H                  9              B9    1              A8    3              D7

   B1             1.02500014
   B2             1.55999997
   B3             1.16294491
   B4             1.19206297
   B5             1.16594125
   B6             1.02500017
   B7             1.61509440
   B8             2.23000016
   B9             2.24925198
   A1           108.40044338
   A2           107.79913385
   A3           104.13348864
   A4           108.15715818
   A5           109.81310314
   A6           103.32096476
   A7           112.99959368
   A8            63.51560810
   D1          -165.65963046
   D2            75.53649029
   D3           -42.82026531
   D4           -55.69106534
   D5            26.30817764
   D6           107.95398143
   D7          -106.38943576

1 3 1.560000 F
1 7 1.025000 F
1 2 1.025000 F
9 1 3 113.000000 F

LiH+AB-end

0 1
N
H                  1              B1
B                  1              B2    2              A1
H                  3              B3    1              A2    2              D1
H                  3              B4    1              A3    2              D2
H                  3              B5    1              A4    2              D3
H                  1              B6    3              A5    4              D4
H                  1              B7    3              A6    4              D5
Li                 1              B8    3              A7    4              D6
H                  9              B9    1              A8    3              D7

   B1             1.02499986
   B2             1.55999913
   B3             1.16378273
   B4             1.19032629
   B5             1.16671001
   B6             1.02499974
   B7             1.87594025
   B8             2.03000000
   B9             2.24598246
   A1           103.87551978
   A2           108.37902716
   A3           104.33642444
   A4           108.53414536
   A5           111.05693728
   A6            86.40593179
   A7           112.99983007
   A8            64.85688418
   D1          -157.14765228
   D2            84.51401036
   D3           -34.25325743
   D4           -48.75299547
   D5            27.87092838
   D6            98.62495834
   D7           -78.89382555

1 3 1.560000 F
1 7 1.025000 F
1 2 1.025000 F
9 1 3 113.000000 F
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-11-28 17:53:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Trouton

新虫 (小有名气)
高手现身啊，求解答啊~~~
赞一下 回复此楼
2楼2011-11-28 19:44:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wygvern

木虫 (职业作家)
★
Trouton(金币+1):谢谢参与
隔行如隔山呀，不懂。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-11-28 20:04:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Jasminer

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★
Trouton(金币+1):谢谢参与
zhou2009(金币+2): 2011-11-29 09:52:10
首先这个反应机理正不正确我不知道。
其次你用hf/sto-3g算过渡态，算得出来是运气，算不出来才正常吧。
赞一下(2人) 回复此楼
5楼2011-11-28 23:07:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Trouton

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by Jasminer at 2011-11-28 23:07:26:
首先这个反应机理正不正确我不知道。
其次你用hf/sto-3g算过渡态，算得出来是运气，算不出来才正常吧。

我不太清楚啊，见过一篇文献是通过这个基组寻找过渡态以后再换高级基组的啊，能指点一下吗，谢谢了。
赞一下 回复此楼
6楼2011-11-29 01:08:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

untrue

铁杆木虫 (职业作家)
★
Trouton(金币+1):谢谢参与
随风飘过
回复此楼
7楼2011-11-29 01:24:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

beefly

专家顾问 (职业作家)
★ ★ ★
Trouton(金币+1):谢谢参与
zhou2009(金币+2): 2011-11-29 09:54:00
引用回帖:
6楼: Originally posted by Trouton at 2011-11-29 01:08:59:
我不太清楚啊，见过一篇文献是通过这个基组寻找过渡态以后再换高级基组的啊，能指点一下吗，谢谢了。

你看的这个文献够老的。如今的计算条件，这个体系用double-zeta级别的基组都不会慢到哪里去。
赞一下(2人) 回复此楼
8楼2011-11-29 03:25:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fatpig8832

铁杆木虫 (著名写手)
★
Trouton(金币+1):谢谢参与
起码先来个b3lyp/6-31g*试试吧，不用固定键长...
赞一下(1人) 回复此楼
9楼2011-11-29 10:13:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

imdiablo1

至尊木虫 (知名作家)
★
Trouton(金币+1):谢谢参与
额。。。看不懂~~~~~~~~~~~~~~
赞一下(1人) 回复此楼
10楼2011-11-29 10:29:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

boylc789

木虫 (著名写手)
★
Trouton(金币+1):谢谢参与
这个确实不好找，与我那个类似，文献刚刚模拟出来，稍微改变点就不行，这个TS虚频太小的缘故
赞一下(1人) 回复此楼
11楼2011-11-29 11:17:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gxsun

至尊木虫 (知名作家)
★
Trouton(金币+1):谢谢参与
不懂啊
回复此楼
12楼2011-11-29 12:00:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

毛毛小虫虫

木虫 (正式写手)
★
Trouton(金币+1):谢谢参与
加油
回复此楼
13楼2011-11-29 12:43:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
davidfrela3楼
2011-11-28 19:51   回复  
Trouton(金币+1):谢谢参与
xiaocui198714楼
2011-11-29 12:51   回复  
Trouton(金币+1):谢谢参与
毛毛爱奋斗15楼
2011-11-29 13:05   回复  
Trouton(金币+1):谢谢参与
相关版块跳转 我要订阅楼主 Trouton 的主题更新
151/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭