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jama69696

新虫 (正式写手)

[求助] 如何设计荧光定量pcr引物? 已有2人参与

如题,分子小白,求助,我现在只会用DNAMAN设计8普通的引物,但是荧光定量pcr的产物应该是小于300bp,那我应该从哪段开始设计引物呢??如何查找基因的内含子和外显子???

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15927635384

新虫 (初入文坛)

我的经验real-time引物最好不要超过200吧。至于在哪一段设计就看你自己实验的目的了

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2楼2017-04-11 16:08:34
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jama69696

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 15927635384 at 2017-04-11 16:08:34
我的经验real-time引物最好不要超过200吧。至于在哪一段设计就看你自己实验的目的了

我有基因的全序列,目的就是想做这个基因表达量的变化

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3楼2017-04-11 19:47:47
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阿拉阿狸

新虫 (正式写手)

晕人一枚
4楼2017-04-11 19:56:45
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jama69696

新虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 阿拉阿狸 at 2017-04-11 19:56:45
有专门网站,搜下

可以提供一下链接么??谢谢

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5楼2017-04-11 20:08:47
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2298827423

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
6楼2017-04-12 14:02:51
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vmp651312

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
一般思路:NCBI搜索基因核苷酸序列,序列里面选择CDS,复制,然后打开premer5 粘贴 ,然后想怎么设计就怎么设计了!当然,很多基因会有很多转录本,这就要选择几条转录本比对,然后在根据比对结果设计引物。
其实最简单的方法,交给引物合成公司,只要提供基因名称和genbank序列号 物种,引物公司就设计合成,引物设计不收费!我是试剂公司的,也可以合成引物,可以加我QQ:122395323详聊!
7楼2017-04-13 14:56:49
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