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gaussian16单点能计算后,可视化spin-density distribution问题
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ljzhou86
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gaussian16单点能计算后,可视化spin-density distribution问题
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想可视化spin-density distribution, 通过gaussian16做完单点能计算,后通过formchk file.chk file.fchk; cubegen 1 SPIN=SCF file.fchk spin.cube 80 h,最后把cube文件导入vesta,为什么看不自旋密度的分布?有知道为什么不?或是怎么解决?谢谢大家
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2017-04-05 14:58:53
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也许你计算的是就是闭壳层,所以没有净自旋密度
还有,木有Gaussian16,能分享不
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2楼
2017-04-05 15:54:42
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首先赞一个用上G16了。
如果你做了open shell计算,fchk文件肯定是有的,cube命令也没错 (很奇怪,检查下你的fchk文件是否成功转化了?)
我的建议是你直接用fchk文件,你可以用Multiwfn直接导入fchk文件,然后计算画出二维自旋密度图。
我是自己写的程序计算这些东西,然后用Matlab画的,不过如果你不需要了解特别底层波函数的东西,Multiwfn就够用了。
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3楼
2017-04-05 16:15:24
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对了,也有可能G16命令不同了,或者cube格式不一样了?
还在用G09的人不是很了解啊!
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2017-04-05 16:16:30
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