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iioowt

金虫 (初入文坛)

[求助] 求助各位虫友!!简并引物调取单克隆抗体重链可变区基因失败已有1人参与

从今年1月开始,一直在用师姐给的cDNA模板和简并引物调取单抗的可变区基因,2月开学后成功调取到轻链VL的基因,但重链一直失败,在经历大概十次失败后,比对这几次的测序结果发现,调出的序列基本都是一个东西,却不是重链基因。此时,开始考虑模板可能有问题,因为pcr的结果就像图1和图2中所显示的那样,总是有杂带,虽然有300-400bp之间的目的条带,但是胶回收送去测序以后发现不是重链的基因。
       于是上周在重新提取RNA逆转录cDNA后,利用新模板进行pcr,结果是轻链VL一次成功,但重链利用pfu酶和taq酶各PCR两次后仍然失败。
       期间针对两种酶做了温度梯度pcr,结果如图3-6.选择pfu酶50和55度产物送去测序结果任然是失败。之前一直使用的是56度。
      简并引物如下:上游:GGRSCTGMRYTGGTGARGCCTGG  
                               下游:GGAGACDGTGASMRKRGTSCCTTGGC
       请各位虫友帮忙看下哪些地方可能出错,提点建议让我的实验可以进行下去。谢谢!!

求助各位虫友!!简并引物调取单克隆抗体重链可变区基因失败
图1:2017.02.22 重链PCR(Taq酶、pfu酶).jpg


求助各位虫友!!简并引物调取单克隆抗体重链可变区基因失败-1
图2:2017.03.12 重链PCR.jpg


求助各位虫友!!简并引物调取单克隆抗体重链可变区基因失败-2
图3:2017.03.28  重链Taq温度梯度PCR(63-58).jpg


求助各位虫友!!简并引物调取单克隆抗体重链可变区基因失败-3
图4;2017.03.28 重链 pfu温度梯度PCR(63-58).jpg


求助各位虫友!!简并引物调取单克隆抗体重链可变区基因失败-4
图5:2017.03.29 重链 pfu温度梯度PCR(55-50).jpg


求助各位虫友!!简并引物调取单克隆抗体重链可变区基因失败-5
图6:2017.03.29 重链 Taq温度梯度PCR(55-50).jpg
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781055707

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

换个引物试试吧,你可以做个巢式,先把你要的大序列吊出来。
采菊东篱下,悠然见南山。
3楼2017-05-17 07:58:09
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sunshine436

新虫 (小有名气)

楼主做出来吗?想问问楼主用的什么引物做的反转录,谢谢

发自小木虫Android客户端
2楼2017-05-17 07:52:02
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781055707

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

PCR这东西,你想快点成功,就引物多设计点。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

采菊东篱下,悠然见南山。
4楼2017-05-17 07:59:41
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马美哥哥

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 781055707 at 2017-05-17 07:58:09
换个引物试试吧,你可以做个巢式,先把你要的大序列吊出来。

你好,巢式的体系是什么

发自小木虫Android客户端
5楼2017-10-13 00:01:22
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