应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » SWISS-MODEL 预测蛋白质二聚体
61/1返回列表
查看: 3012  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

五彩心灯

铁虫 (初入文坛)

[求助] SWISS-MODEL 预测蛋白质二聚体 已有1人参与

有个已知的蛋白，想用swiss-model 预测能否形成分子间的二聚体，如何操作？@oxox6085
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2017-03-13 10:27:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

五彩心灯

铁虫 (初入文坛)
请问如何预测某个蛋白质能否形成分子间的二聚体？

发自小木虫Android客户端
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2017-03-13 12:05:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jhjjy2013

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你可以试试在swiss model 中写上两条链的蛋白序列试试，不过我也没有做过，猜测应该是可以的。
另外其它同源建模软件也能实现上述要求，如Modeller等。
赞一下 回复此楼
3楼2017-03-13 15:46:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

五彩心灯

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by jhjjy2013 at 2017-03-13 15:46:49
你可以试试在swiss model 中写上两条链的蛋白序列试试，不过我也没有做过，猜测应该是可以的。
另外其它同源建模软件也能实现上述要求，如Modeller等。

不行，我试了。两个链放到一块，还是给出一个模型。

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
4楼2017-03-14 17:21:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jhjjy2013

银虫 (初入文坛)
你用modeller试试，不过这个不太好学

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
5楼2017-03-14 21:54:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jjxa

新虫 (初入文坛)
SWISS-MODLE建模时点击start modelling 然后点击右侧User temple 按钮，你想建二聚体模型，先将你的待建模型序列粘上去，然后自己在PDB数据库里下载一个二聚体模板（template），将这个模板手动粘到template File中，点击建模就可以了。重点是下载PDB中已有二聚体的文件为模板这一步，你要对你的蛋白有一些了解，寻找时可以在PDB里BLUST,然后筛选二聚体模型。不知道你的问题解决了没有，希望能帮到有类似问题的小伙伴吧！
赞一下(2人) 回复此楼
6楼2018-01-02 17:52:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 五彩心灯 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭