24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 2882  |  回复: 13
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

薛定谔的老虎

新虫 (初入文坛)

[交流] 有谁会用MEGA做基因组合分析构建树图的吗 已有4人参与

我刚刚上手这个软件,目前只会简单的多序列构建树图,我目前手上有昆虫18S  28S  和COI的基因,想联合这3个基因做一个组合聚类分析构建一个系统发育图,看亲缘关系。但是不太会做组合聚类的分析。百度的教程也只有多序列分析,谁能教我一下吗。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

薛定谔的老虎

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
9楼: Originally posted by xtgojian72 at 2017-03-01 22:36:08
直接一个个接好就行

我试过 用seqman直接接18S 28S和COI,但是还是接不上,提示每个基因都是single seqence ,是不是要经过什么处理。
10楼2017-03-02 17:27:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答

xtgojian72

新虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2017-02-26 08:57:17
先分别将三个基因构建进化树。构建进化树时,每个基因所选的参考菌株均为模式菌株,而且建树的所有菌株必须比对后两端进行人工校正。然后,将校正后的同一菌种的三个基因按相同的顺序拼接,再构建进化树。OK?

发自小木虫Android客户端
2楼2017-02-26 06:05:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xtgojian72

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
且建树的所有菌株的基因序列必须比对后两端进行人工校正。

发自小木虫Android客户端
3楼2017-02-26 06:07:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

薛定谔的老虎

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xtgojian72 at 2017-02-26 06:05:16
先分别将三个基因构建进化树。构建进化树时,每个基因所选的参考菌株均为模式菌株,而且建树的所有菌株必须比对后两端进行人工校正。然后,将校正后的同一菌种的三个基因按相同的顺序拼接,再构建进化树。OK?
...

是不是就是,列如先把18S和28S的分别用mega构树,然后保存序列,在用保存的序列进行拼接,拼接的结果再来构树~
4楼2017-02-26 16:53:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085600 286分 材料求调剂 +11 麻辣鱿鱼 2026-03-27 12/600 2026-03-30 19:33 by Wang200018
[考研] 311求调剂 +7 蓝月亮亮 2026-03-30 7/350 2026-03-30 19:24 by 无际的草原
[考研] 295材料工程专硕求调剂 +10 1428151015 2026-03-27 10/500 2026-03-30 19:00 by 源_2020
[考研] 一志愿南开大学0710生物学359求调剂 +5 兔兔兔111223314 2026-03-29 7/350 2026-03-30 18:29 by 兔兔兔111223314
[考研] 328求调剂 +8 嗯滴的基本都 2026-03-27 8/400 2026-03-30 17:20 by Wang200018
[考研] 284求调剂 +14 junqihahaha 2026-03-26 15/750 2026-03-30 14:12 by 探123
[考研] 0703化学/290求调剂/本科经历丰富/工科也可 +13 丹青奶盖 2026-03-26 15/750 2026-03-30 12:35 by fangnagu
[考研] 生物技术与工程 +7 1294608413 2026-03-25 8/400 2026-03-30 11:36 by 唐沐儿
[考研] 085602 化学工程专硕 340分求调剂 +4 qianbai11 2026-03-29 4/200 2026-03-30 11:34 by 唐沐儿
[考研] 化学工程085602 305分求调剂 +25 RichLi_ 2026-03-25 25/1250 2026-03-30 11:02 by klasasda
[考研] 375求调剂 +6 雨夏整夜 2026-03-29 6/300 2026-03-30 10:21 by herarysara
[考研] 275求调剂 +15 Micky11223 2026-03-25 20/1000 2026-03-29 20:44 by 唐沐儿
[考研] 343求调剂085601 +3 要努力学习x 2026-03-29 3/150 2026-03-29 18:35 by wxiongid
[考研] 2026年华南师范大学欢迎化学,化工,生物,生医工等专业优秀学子加入! +3 llss0711 2026-03-28 6/300 2026-03-29 10:26 by llss0711
[考研] 311(085601)求调剂 +4 liziyeyeye 2026-03-28 4/200 2026-03-28 18:50 by 535743368
[考研] 085405 考的11408求各位老师带走 +3 Qiu学ing 2026-03-28 3/150 2026-03-28 09:19 by 乐呵呵的追梦人
[考研] 295求调剂 +5 1428151015 2026-03-27 6/300 2026-03-28 04:04 by fmesaito
[考研] 中国科学院深圳先进技术研究院-光纤传感课题组招生-中国科学院大学、深圳理工大学联培 +5 YangTyu1 2026-03-26 5/250 2026-03-26 18:27 by 猫咪猫咪呀
[考研] 085601求调剂总分293英一数二 +4 钢铁大炮 2026-03-24 4/200 2026-03-26 16:28 by dick_runner
[考研] 285求调剂 +3 AZMK 2026-03-24 3/150 2026-03-25 12:23 by userper
信息提示
请填处理意见