应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 有谁会用MEGA做基因组合分析构建树图的吗
141/2返回列表12下一页
查看: 2855  |  回复: 13
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

薛定谔的老虎

新虫 (初入文坛)

[交流] 有谁会用MEGA做基因组合分析构建树图的吗 已有4人参与

我刚刚上手这个软件，目前只会简单的多序列构建树图，我目前手上有昆虫18S  28S  和COI的基因，想联合这3个基因做一个组合聚类分析构建一个系统发育图，看亲缘关系。但是不太会做组合聚类的分析。百度的教程也只有多序列分析，谁能教我一下吗。
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2017-02-25 20:20:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

xtgojian72

新虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2017-02-26 08:57:17
先分别将三个基因构建进化树。构建进化树时，每个基因所选的参考菌株均为模式菌株，而且建树的所有菌株必须比对后两端进行人工校正。然后，将校正后的同一菌种的三个基因按相同的顺序拼接，再构建进化树。OK？

发自小木虫Android客户端
赞一下(3人) 回复此楼
2楼2017-02-26 06:05:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

xtgojian72

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
且建树的所有菌株的基因序列必须比对后两端进行人工校正。

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
3楼2017-02-26 06:07:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

薛定谔的老虎

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xtgojian72 at 2017-02-26 06:05:16
先分别将三个基因构建进化树。构建进化树时，每个基因所选的参考菌株均为模式菌株，而且建树的所有菌株必须比对后两端进行人工校正。然后，将校正后的同一菌种的三个基因按相同的顺序拼接，再构建进化树。OK？
...

是不是就是，列如先把18S和28S的分别用mega构树，然后保存序列，在用保存的序列进行拼接，拼接的结果再来构树~
赞一下 回复此楼
4楼2017-02-26 16:53:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xtgojian72

新虫 (小有名气)
是

发自小木虫Android客户端
5楼2017-02-26 20:05:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

薛定谔的老虎

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by xtgojian72 at 2017-02-26 20:05:39
是

谢谢大佬~么么哒
赞一下 回复此楼
6楼2017-02-26 23:57:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

薛定谔的老虎

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by xtgojian72 at 2017-02-26 20:05:39
是

大神大神，我又来请教你了。。当我用MEGA整理一系列列如18S的序列时，18S的几十个序列文件两端都已经被我切整齐，然后保存，但是这个文件是一个集合文件而且是mas格式，，，，好像导入不进DNAstar，，，我咋个把已经切好的个别序列分离出来啊，，，，
赞一下 回复此楼
7楼2017-03-01 20:00:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

薛定谔的老虎

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by xtgojian72 at 2017-02-26 20:05:39
是

大神大神~，刚刚那个问题我已经解决了，可是我去除两端后保存的文件，用seqMan拼接不起来啊，，，，，接不起来。提示我不定位重叠，咋个弄咧
赞一下 回复此楼
8楼2017-03-01 21:13:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xtgojian72

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
直接一个个接好就行

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
9楼2017-03-01 22:36:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

薛定谔的老虎

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
9楼: Originally posted by xtgojian72 at 2017-03-01 22:36:08
直接一个个接好就行

我试过 用seqman直接接18S 28S和COI，但是还是接不上，提示每个基因都是single seqence ,是不是要经过什么处理。
赞一下 回复此楼
10楼2017-03-02 17:27:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 薛定谔的老虎 的主题更新
141/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 323求调剂 +6 洼小桶 2026-03-18 6/300 2026-03-23 00:29 by king123！
[考研] 一志愿华中科技大学071000，求调剂 +4 沿岸有贝壳6 2026-03-21 4/200 2026-03-22 07:21 by ilovexiaobin
[考研] 286求调剂 +10 Faune 2026-03-21 10/500 2026-03-21 23:34 by 314126402
[考研] 材料求调剂 +5 @taotao 2026-03-21 5/250 2026-03-21 20:55 by lbsjt
[考研] 工科0856求调剂 +3 沐析汀汀 2026-03-21 3/150 2026-03-21 18:30 by 学员8dgXkO
[考研] 求调剂 +3 13341 2026-03-20 3/150 2026-03-21 18:28 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿深大，0703化学，总分302，求调剂 +4 七月-七七 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:20 by 学员8dgXkO
[考研] 296求调剂 +4 www_q 2026-03-20 4/200 2026-03-21 17:26 by 学员8dgXkO
[考研] 279分求调剂 一志愿211 +14 chaojifeixia 2026-03-19 15/750 2026-03-21 13:24 by zhukairuo
[考研] 材料学学硕080502 337求调剂-一志愿华中科技大学 +4 顺顺顺mr 2026-03-18 5/250 2026-03-21 10:22 by luoyongfeng
[考研] 求调剂 +6 Mqqqqqq 2026-03-19 6/300 2026-03-21 08:04 by JourneyLucky
[考研] 机械专硕299求调剂至材料 +3 kkcoco25 2026-03-16 4/200 2026-03-21 03:52 by JourneyLucky
[考研] 301求调剂 +10 yy要上岸呀 2026-03-17 10/500 2026-03-21 03:14 by JourneyLucky
[考研] 华东师范大学-071000生物学-293分-求调剂 +3 研究生何瑶明 2026-03-18 3/150 2026-03-21 01:30 by JourneyLucky
[考研] 290求调剂 +7 ^O^乜 2026-03-19 7/350 2026-03-20 21:43 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +3 @taotao 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:35 by JourneyLucky
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +7 困于星晨 2026-03-17 9/450 2026-03-20 17:38 by 无懈可击111
[考研] 298-一志愿中国农业大学-求调剂 +9 手机用户 2026-03-17 9/450 2026-03-20 14:24 by 无懈可击111
[考研] 收复试调剂生 +4 雨后秋荷 2026-03-18 4/200 2026-03-18 14:16 by elevennnne
[硕博家园] 湖北工业大学 生命科学与健康学院-课题组招收2026级食品/生物方向硕士 +3 1喜春8 2026-03-17 5/250 2026-03-17 17:18 by ber川cool子
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭