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tomcat3

新虫 (初入文坛)

[交流] MS教程里CO吸附那个为什么C和O之间是单键呢？查资料都说是三键才对 已有4人参与

MS教程里CO吸附那个为什么C和O之间是单键呢？查资料都说是三键才对。而且计算完之后CO依然是单键，这对最终的吸附能计算没有影响吗？
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1楼 2017-02-10 17:27:43
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卡开发发

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5楼: Originally posted by tomcat3 at 2017-02-12 17:06:20
这也是我最奇怪的地方，即使是用castep计算以后，最终结果C O之间也是单键？还有另外一个问题，我把C 换成O之后（也就是一氧化碳换成了氧气）其他一切都不变，再进行计算就总是出错，平均原子能量不收敛，怎么回事 ...

1、显示什么键无所谓，2L说的是对的，键显示的依据可能是根据原子类型、键长、键角等因素判断键的类型，这种判断方式并不是第一原理的方式，你可以考虑计算重叠布居和键级等来进行判断，当然，这也只是一种参考的指标罢了。
2、导致难收敛的因素有很多，比较可能的一个问题就是，CO是单重态稳定，O2是三重态稳定，还是尝试给两个O分别spin=1.0（你可以在modify->electronic configuation设置）然后把自旋极化打开再计算。，其他的因素还可能是这种直立的吸附方式也有可能不适合O2。
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6楼2017-02-12 17:52:57
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卡开发发

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7楼: Originally posted by tomcat3 at 2017-02-12 18:19:39
呃。。。太高深了，有点看不懂
那个O2那个，我还没有计算吸附，模型里只有O2...

只有O2那就是三重态的问题导致的，如果你要是按照单重态初猜或者索性按照非自旋极化做做出来多半出毛病（即便做出来也是错的）。

如果你调整过初始自旋并且开了自旋极化进行计算，如果难收敛的话可以控制一下计算精度，如果还不行，可以调整一下density mixing，O2这个体系不算大，实在不行直接Allbands/EDFT也成。
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8楼2017-02-12 18:23:10
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cloverliang

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那个是什么键没关系的，只是显示问题
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2楼2017-02-11 14:04:42
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tomcat3

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2楼: Originally posted by cloverliang at 2017-02-11 14:04:42
那个是什么键没关系的，只是显示问题

你是说显示成单键，实际也可能是双键或三键？但那个键是可以编辑的，单键就是代表单键吧

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3楼2017-02-12 11:04:39
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cloverliang

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3楼: Originally posted by tomcat3 at 2017-02-12 11:04:39
你是说显示成单键，实际也可能是双键或三键？但那个键是可以编辑的，单键就是代表单键吧
...

C O 之间是什么键，需要优化，然后分析得出。
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4楼2017-02-12 14:36:31
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tomcat3

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4楼: Originally posted by cloverliang at 2017-02-12 14:36:31
C O 之间是什么键，需要优化，然后分析得出。...

这也是我最奇怪的地方，即使是用castep计算以后，最终结果C O之间也是单键？还有另外一个问题，我把C 换成O之后（也就是一氧化碳换成了氧气）其他一切都不变，再进行计算就总是出错，平均原子能量不收敛，怎么回事？

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5楼2017-02-12 17:06:20
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tomcat3

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6楼: Originally posted by 卡开发发 at 2017-02-12 17:52:57
1、显示什么键无所谓，2L说的是对的，键显示的依据可能是根据原子类型、键长、键角等因素判断键的类型，这种判断方式并不是第一原理的方式，你可以考虑计算重叠布居和键级等来进行判断，当然，这也只是一种参考的指 ...

呃。。。太高深了，有点看不懂
那个O2那个，我还没有计算吸附，模型里只有O2
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7楼2017-02-12 18:19:39
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tomcat3

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8楼: Originally posted by 卡开发发 at 2017-02-12 18:23:10
只有O2那就是三重态的问题导致的，如果你要是按照单重态初猜或者索性按照非自旋极化做做出来多半出毛病（即便做出来也是错的）。

如果你调整过初始自旋并且开了自旋极化进行计算，如果难收敛的话可以控制一下计 ...

十分感谢。那请教下怎么调整两个氧原子的自旋呢？直接将electronic configuation对话窗里的spin改成+1，其他的都不变？
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9楼2017-02-12 19:11:16
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卡开发发

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9楼: Originally posted by tomcat3 at 2017-02-12 19:11:16
十分感谢。那请教下怎么调整两个氧原子的自旋呢？直接将electronic configuation对话窗里的spin改成+1，其他的都不变？...

对头。理论上说正确修改之后你的Castep Calculation选项卡的initial spin就显示是2了。
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10楼2017-02-12 19:30:31
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