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feidianmaomao

木虫 (小有名气)

[求助] autodock分子对接过程中金属配合物的配位键如何处理

做到一个含锌配合物的小分子,在用autodock分子对接过程中发现打分不稳定,小分子在前期能量最小化出错。请问配位键如何处理,有大神说固定配位键,在pdbqt文件中改,求问有没有详细指导。
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wbf3ng

金虫 (小有名气)

2楼2017-01-10 14:42:20
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feidianmaomao

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wbf3ng at 2017-01-10 14:42:20
zn的力学参数加了没

是autodock里面的zn参数吗?它里面本来就有。
3楼2017-01-10 15:00:45
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HHHH0099

银虫 (小有名气)

请问可以讨教下autodock么?本人刚涉猎
4楼2017-01-19 14:05:39
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lipeng43

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by feidianmaomao at 2017-01-10 15:00:45
是autodock里面的zn参数吗?它里面本来就有。...

请问金属离子参数在那个里面?求指导,谢谢
5楼2017-03-26 10:09:26
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