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qs8lhy86

新虫 (初入文坛)

[交流] Ni-NTA亲和层析纯化蛋白的问题(不挂柱!)

我的目的蛋白大小在29KDA左右,连接质粒用的是PET28a,双酶切用的是Bam HI 和Hind Ⅲ,诱导表达后发现目的蛋白主要在上清中(图一),做Ni柱亲和层析用的binding buffer含10mM咪唑,洗脱液分别用 50、100、250mM咪唑,电泳图(图二)显示蛋白并没有洗脱下来,而在最开始的10mM咪唑时似乎就已经洗脱下来了(最右条带)。

问题一:图二的电泳图是否说明我的目的蛋白与Ni柱没有结合上或者结合的很弱?我想的解决办法是把Ni-NTA resin先与蛋白混合,孵育一段时间再上柱,是否可行?

问题二:用PET 28a和Bam HI和Hind Ⅲ双酶切,我的目的蛋白一定会带上HIS标签吗?我担心可能是HIS标签被包埋,根据蛋白的分子量(29KDA)有这种可能吗?我想的解决办法是处理蛋白时binding buffer和elution buffer 都加8M的尿素,但我的是上清不是包涵体,这样是否可行?

问题三:处理蛋白时我加的binding buffer含有10mM咪唑,是否影响目的蛋白与Ni2+ 的结合?

我很困惑,请高人帮我分析原因和建议。感谢!
Ni-NTA亲和层析纯化蛋白的问题(不挂柱!)
图一


Ni-NTA亲和层析纯化蛋白的问题(不挂柱!)-1
图二
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qs8lhy86

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by diaomou at 2016-12-29 17:15:55
问题一,应该是没结合。可以试试取一点上清,加一点Ni柱(这样Ni柱占的比例就加大很多),孵育、电泳试试。也可以试试离子交换层析。
问题二,8M的尿素变性蛋白,跟是不是包涵体没关系吧?
问题三,10mM咪唑不影响 ...

binding buffer 里不加咪唑会不会对结合有帮助?

发自小木虫Android客户端
4楼2016-12-29 21:31:11
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diaomou

新虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2017-02-08 21:28:20
问题一,应该是没结合。可以试试取一点上清,加一点Ni柱(这样Ni柱占的比例就加大很多),孵育、电泳试试。也可以试试离子交换层析。
问题二,8M的尿素变性蛋白,跟是不是包涵体没关系吧?
问题三,10mM咪唑不影响结合。一般用20mM咪唑洗去杂蛋白。
2楼2016-12-29 17:15:55
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3楼2016-12-29 17:17:00
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氺泽兮木兰

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
应该可以结合一段时间在上柱。如果不是包涵体蛋白,应该没有必要用8M尿素处理吧。初始低浓度咪唑可以用来洗杂蛋白,应该是不会影响目标蛋白的结合的

发自小木虫Android客户端
5楼2017-02-08 16:46:29
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