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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 放线菌鉴定
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th13336225

新虫 (小有名气)

[求助] 放线菌鉴定 已有1人参与

文章投稿中，审稿专家让进行详细的菌株鉴定过程，提供系统发育树，是一株放线菌，当时只做了16s DNA 测序，BLAST结构与链霉菌属的菌株99%相似，请教有没有比较熟悉放线菌的同行可以帮忙建个系统发育树，确定种属
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1楼 2016-12-20 20:21:03
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大美妞科学家

金虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by th13336225 at 2016-12-20 21:11:31
因为修稿时间有限，做生化鉴定可能来不及的，菌株鉴定这一块实在是外行，找人建了个树，结果出来是戈登氏菌属，和BLAST结构完全不一样，在想是不是比对菌株选择的不太好，自己也不懂，所以只能用这个方法寻求帮助了 ...

那戈登的相似度多少啊？没准儿就是呢。blast不就可以建树么 你是就看一眼大概是什么菌还是要拿出证据啊？一定要报告的话你去找检测中心 15个工作日就有结果。

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8楼2016-12-20 21:19:49
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大美妞科学家

金虫 (正式写手)
链霉菌99%以上的太多了 建树也不能鉴定到种 要么做生理生化 要么dna杂交

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2楼2016-12-20 20:46:29
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liuhaolin3

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 大美妞科学家 at 2016-12-20 20:46:29
链霉菌99%以上的太多了 建树也不能鉴定到种 要么做生理生化 要么dna杂交

你是微生物所的吗？是做放线菌的？

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3楼2016-12-20 20:55:48
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大美妞科学家

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by liuhaolin3 at 2016-12-20 20:55:48
你是微生物所的吗？是做放线菌的？
...

以前做放线菌表型鉴定的

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4楼2016-12-20 21:01:02
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