| 查看: 2077 | 回复: 10 | ||
[求助]
放线菌鉴定 已有1人参与
|
||
| 文章投稿中，审稿专家让进行详细的菌株鉴定过程，提供系统发育树，是一株放线菌，当时只做了16s DNA 测序，BLAST结构与链霉菌属的菌株99%相似，请教有没有比较熟悉放线菌的同行可以帮忙建个系统发育树，确定种属 |
回复此楼» 猜你喜欢
只有每年这种时候来逛逛小木虫
已经有23人回复
-
估计是周四
已经有3人回复
-
基金啊基金
已经有3人回复
-
科研孤儿太难了
已经有15人回复
-
让我中一个面上吧！
已经有10人回复
-
言之凿凿，明天官网会通知放榜？
已经有17人回复
-
时间戳又变了
已经有17人回复
-
今天系统多次维护，明天很可能放榜！
已经有11人回复
-
时间戳变了，能看出什么问题？
已经有23人回复
-
放榜前的不淡定
已经有12人回复
大美妞科学家
金虫 (正式写手)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 1769.2
- 散金: 212
- 红花: 7
- 帖子: 386
- 在线: 110.1小时
- 虫号: 1487886
- 注册: 2011-11-12
- 性别: MM
- 专业: 微生物生理与生物化学
6楼2016-12-20 21:07:56
大美妞科学家
金虫 (正式写手)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 1769.2
- 散金: 212
- 红花: 7
- 帖子: 386
- 在线: 110.1小时
- 虫号: 1487886
- 注册: 2011-11-12
- 性别: MM
- 专业: 微生物生理与生物化学
2楼2016-12-20 20:46:29
liuhaolin3
至尊木虫 (著名写手)
- 应助: 94 (初中生)
- 金币: 16919.5
- 红花: 15
- 帖子: 1163
- 在线: 178.7小时
- 虫号: 1116160
- 注册: 2010-10-08
- 性别: GG
- 专业: 微生物资源与分类学
3楼2016-12-20 20:55:48
大美妞科学家
金虫 (正式写手)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 1769.2
- 散金: 212
- 红花: 7
- 帖子: 386
- 在线: 110.1小时
- 虫号: 1487886
- 注册: 2011-11-12
- 性别: MM
- 专业: 微生物生理与生物化学
4楼2016-12-20 21:01:02
5楼2016-12-20 21:01:21
|
因为修稿时间有限，做生化鉴定可能来不及的，菌株鉴定这一块实在是外行，找人建了个树，结果出来是戈登氏菌属，和BLAST结构完全不一样，在想是不是比对菌株选择的不太好，自己也不懂，所以只能用这个方法寻求帮助了 发自小木虫Android客户端 |
7楼2016-12-20 21:11:31
大美妞科学家
金虫 (正式写手)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 1769.2
- 散金: 212
- 红花: 7
- 帖子: 386
- 在线: 110.1小时
- 虫号: 1487886
- 注册: 2011-11-12
- 性别: MM
- 专业: 微生物生理与生物化学
8楼2016-12-20 21:19:49
|
blast出的页面中根本就没有戈登氏菌，那一页基本都是链霉属的，所以感觉他建的树不太对。我不需要鉴定的太细，因为我是做天然产物的，只是物质是从放线菌中分离纯化到的，所以需要鉴定一下我的菌株，审稿专家让我提供详细的一些数据，序列，发育树和引物信息，结果在建树这出现问题 发自小木虫Android客户端 |
9楼2016-12-20 22:00:20
10楼2016-12-21 12:10:43
40