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th13336225

新虫 (小有名气)

[求助] 放线菌鉴定 已有1人参与

文章投稿中,审稿专家让进行详细的菌株鉴定过程,提供系统发育树,是一株放线菌,当时只做了16s DNA 测序,BLAST结构与链霉菌属的菌株99%相似,请教有没有比较熟悉放线菌的同行可以帮忙建个系统发育树,确定种属
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th13336225

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 大美妞科学家 at 2016-12-20 20:46:29
链霉菌99%以上的太多了 建树也不能鉴定到种 要么做生理生化 要么dna杂交

因为修稿时间有限,做生化鉴定可能来不及的,菌株鉴定这一块实在是外行,找人建了个树,结果出来是戈登氏菌属,和BLAST结构完全不一样,在想是不是比对菌株选择的不太好,自己也不懂,所以只能用这个方法寻求帮助了

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7楼2016-12-20 21:11:31
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大美妞科学家

金虫 (正式写手)

链霉菌99%以上的太多了 建树也不能鉴定到种 要么做生理生化 要么dna杂交

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2楼2016-12-20 20:46:29
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liuhaolin3

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 大美妞科学家 at 2016-12-20 20:46:29
链霉菌99%以上的太多了 建树也不能鉴定到种 要么做生理生化 要么dna杂交

你是微生物所的吗?是做放线菌的?

发自小木虫Android客户端
3楼2016-12-20 20:55:48
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大美妞科学家

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by liuhaolin3 at 2016-12-20 20:55:48
你是微生物所的吗?是做放线菌的?
...

以前做放线菌表型鉴定的

发自小木虫IOS客户端
4楼2016-12-20 21:01:02
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