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18252710045

新虫 (初入文坛)

[交流] 菜鸡入门~请问荧光定量PCR如何根据CT值计算基因表达量做出图表~在线等~急 已有4人参与

小弟刚开始做QRT-PCR的实验,很多东西不懂,想请教一下大神们。
我现在是在用荧光定量筛选基因,没有处理组,样品就是最原始的植物。现在荧光定量跑完了,要做出图表来,如何根据目的基因和内参的CT值,计算目的基因的表达量呢?我看了很多△△ct的方法,那些似乎都是计算处理组和对照组之间的相对表达量,那么我这个没有处理组,应该如何计算呢?
不知道我说清楚没有。举个例子
目的   22
内参   18
△CT=22-18=4
我只有这些,那么接下来怎么分析数据做图表呢?
因为我有几十个基因,就是比较几十个基因的表达量,看哪个高哪个低,样品是单一的。
在线等~急求指教
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月夜鸣鸣

铜虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
将其中一个基因的表达量作为参照就可以了,最好是同一批做下来,分批做也可以,但每次都要把该基因作为参照,而且每次该基因的ct值不能有太大出入,这样就可以比较不同基因表达量了

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3楼2016-12-05 13:48:11
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叹汁杰

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
相对定量不同基因不能比较吧。引物设计好坏都会影响扩增结果,就是你同样一个基因序列,设计出多个引物去做qpcr的结果都会不一样。。或者你去做绝对定量看看,利用标准品做标准曲线应该就可以了

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2楼2016-12-05 13:36:46
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18252710045

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 叹汁杰 at 2016-12-05 13:36:46
相对定量不同基因不能比较吧。引物设计好坏都会影响扩增结果,就是你同样一个基因序列,设计出多个引物去做qpcr的结果都会不一样。。或者你去做绝对定量看看,利用标准品做标准曲线应该就可以了
...

你说的对。。。那我这种数据应该怎么处理啊?
4楼2016-12-05 15:53:52
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叹汁杰

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by 18252710045 at 2016-12-05 15:53:52
你说的对。。。那我这种数据应该怎么处理啊?...

我觉得是不能比的,你根本不能说明某个基因的Ct值很大是实际上这个基因的表达量本来就很少,还是因为由于你对这个基因的引物设计不好,或者没有选择该基因的最优温度来做,又或者是这一次仪器对荧光信号的吸收程度不一样导致的。等等。。然后如果做绝对定量的话,估计你就得重新去做了。

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5楼2016-12-05 18:24:53
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