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shuting1994新虫 (小有名气)
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[求助]
Lammps并行速度比串行速度慢很多，是什么原因呢？ 已有3人参与
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自己在服务器上安装的并行lammps，以一个4千原子1万步的脚本为例子，发现并行输入mpirun -n 28 lmp_mpi < in.text. 输出log里显示1 by 14 by 2 mpi processor grid ,说明应该是并行计算了，结果算了32分19秒；同样的脚本我输入串行lmp_serial < in.bn，结果2分08秒就算出来了，心塞的不行，请问有哪位高手知道这是什么原因？多谢 发自小木虫Android客户端 |
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shuting1994
新虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
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- 红花: 5
- 帖子: 299
- 在线: 78.8小时
- 虫号: 4795892
- 注册: 2016-06-25
- 专业: 分析化学
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是的，因为我的体系很小，我后来对自己的结果也产生怀疑，请问你做过类似测试吗，体系的计算时间选取多长比较合适呢？还有请问你所提到的数据通讯和数据交流分别指什么意思呢？我的理解是数据通讯是指数据从我的端口提交到服务器所花的时间，是这样的吗，太感谢你啦！ 发自小木虫Android客户端 |
7楼2016-12-02 19:50:34
abinitio
版主 (著名写手)
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- 管辖: 分子模拟
shuting19942楼2016-12-01 08:29:16
3楼2016-12-02 09:43:21
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shuting1994: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2016-12-02 19:46:04
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4楼2016-12-02 12:31:38
20