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siyuansing

银虫 (小有名气)

[求助] 无缝克隆后平板不长菌落已有3人参与

无缝克隆使用全式金的无缝克隆试剂盒,诺维赞的无缝克隆试剂盒,NEB的T4聚合酶,都效果甚微。
用全式金的试剂盒做出来过2个克隆,后来就无论怎么做都做不出来。就是平板上不长菌落,检查过引物,肯定没有问题,PCR扩增也很好。目的片段和载体的比例都是在2:1到3:1之间。目的片段2000kb,载体4000kb。不知道提高总的DNA量会不会有效果,请大家给个建议。
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臧连毅

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by siyuansing at 2016-11-20 22:14:33
同源臂15bp,载体通过酶切线性化,都是胶回收。全式金的引物设计方案是把粘性末端算在同源臂上,有个同学说不能算粘性末端。两种方法都试过,做出来的那一次是前引物同源臂有粘性末端,后引物没有粘性末端。模板和 ...

您好 ,我想问一下,你的模板和目的基因如何进行的浓缩,我最近在做无缝克隆,就是不长斑,回收后的浓度很低
13楼2018-09-04 19:34:16
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glybacter

新虫 (初入文坛)


kuaile5420: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-11-23 20:50:33
同源臂设计的多长,载体是用PCR扩增的吗,还有载体和目的片段胶回收有没有?我最近这个研究的比较多,可以交流下
2楼2016-11-20 16:35:19
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siyuansing

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by glybacter at 2016-11-20 16:35:19
同源臂设计的多长,载体是用PCR扩增的吗,还有载体和目的片段胶回收有没有?我最近这个研究的比较多,可以交流下

同源臂15bp,载体通过酶切线性化,都是胶回收。全式金的引物设计方案是把粘性末端算在同源臂上,有个同学说不能算粘性末端。两种方法都试过,做出来的那一次是前引物同源臂有粘性末端,后引物没有粘性末端。模板和目的基因的摩尔浓度比例基本都是1比2到1比3。今天把模板和目的基因都浓缩了,都是100多ng(刚从实验室回来,不记得具体的数据了),模板加了2微,目的基因加了3微。不知道明天结婚怎么样。不知道兄台有什么经验可以传授的?非常感谢!

发自小木虫IOS客户端
3楼2016-11-20 22:14:33
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飞鸟向前

新虫 (初入文坛)

请问楼主解决了么?我也是做无缝克隆转化不成功(平板不长菌),已经试过两家公司的试剂盒了,快奔溃了。。
4楼2016-11-21 13:29:41
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